lncRNA

摘要： 背景:目前非编码RNA已被证实在多种骨科疾病中发挥重要作用,因此,非编码RNA可能为了解该疾病的病因、发病机制、治疗方法带来新的思路。目的:探索早期诊断、治疗股骨头坏死的方法和思路,综述非编码RNA在股骨头坏死中的研究进展,并提出目前所存在的问题及解决方法。方法:以“股骨头坏死,非编码RNA,miRNA,lncRNA,circRNA”为检索词检索中国知网、万方、维普等数据库,以“osteonecrosis of the femoral head,non-coding RNAs,miRNA,lncRNA,circRNA”为检索词检索PubMed、Medline等数据库,检索时限均为2000年1月至2021年11月。最终纳入67篇文献。结果与结论:(1)非编码RNA的种类非常丰富,大约占所有转录产物的98%,同时占所有RNA的90%左右,根据其功能可分为管家非编码RNA(如tRNA、rRNA、snoRNA)以及调节非编码RNA(如miRNA、lncRNA、circRNA、siRNA);(2)目前miRNAs与激素型股骨头坏死的研究逐渐成为热点,而外泌体lncRNAs、circRNAs与股骨头坏死的相关研究尚未见到报道;(3)多数非编码RNA在发生激素型股骨头坏死时表达下调,大部分非编码RNA通过负向调控其相关靶基因,以促进骨髓间充质干细胞增殖、成骨分化,促进成骨标记物的表达,也可以促进血管内皮细胞生成,从而抑制股骨头缺血性坏死的发生及进展;(4)外泌体携带的非编码RNA也可以在股骨头坏死中发生作用,但目前文献量较少,非编码RNA是否通过外泌体携带所产生的作用目前暂不清楚,在未来的研究中可逐渐完善;(5)利用非编码RNA类似物和抑制剂可以有效抑制非创伤性股骨头坏死的发生发展,可以为非创伤性股骨头坏死的早期诊断和治疗提供新的策略。

摘要： 背景:近来发现骨髓炎环境会显著抑制骨髓间充质干细胞的成骨分化能力,进而对骨形成和骨代谢造成影响,但其具体的作用机制尚不十分清楚。目的:通过对葡萄球菌A蛋白作用下诱导成骨分化的大鼠骨髓间充质干细胞进行转录组分析,寻找潜在差异表达长链非编码RNA(lncRNA)及相关调控网络。方法:将大鼠骨髓间充质干细胞分为实验组和对照组,前者在葡萄球菌A蛋白(1μg/mL)模拟的骨髓炎环境下成骨诱导分化7,14 d,后者正常成骨诱导分化7,14 d;通过茜素红染色以及碱性磷酸酶活性检测观察两组细胞成骨诱导分化情况;收集两组细胞进行转录组测序,进行GO、KEGG生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR进一步验证差异表达lncRNA。结果与结论:①成骨诱导分化7,14 d,对照组茜素红着色面积均高于实验组,对照组碱性磷酸酶活性明显高于实验组(P<0.01);②转录组测序结果显示328个lncRNAs表达差异,其中显著上调的184个,显著下调的144个;③基因本体富集分析发现差异表达基因功能主要涉及生物过程、细胞组分以及分子功能,KEGG富集分析发现主要参与的信号转导途径有肿瘤坏死因子信号通路、MAPK信号通路、肠道炎症疾病通路等,与骨形成、骨代谢相关;④选取与成骨分化相关的差异表达明显的6个lncRNAs,qPCR验证后发现ENSRNOT00000092811、TCONS_00023877、XR_001836916.1与高通量测序中的表达趋势一致;⑤结果表明,多个lncRNA参与骨髓炎状态的大鼠骨髓间充质干细胞成骨分化能力调节,且可能通过信号转导途径肿瘤坏死因子信号通路、MAPK信号通路等发挥作用。

摘要： Research has shown that long-chain noncoding RNAs(lncRNAs) are involved in the regulation of a variety of biological processes, including peripheral nerve regeneration, in part by acting as competing endogenous RNAs. c-Jun plays a key role in the repair of peripheral nerve injury. However, the precise underlying mechanism of c-Jun remains unclear. In this study, we performed microarray and bioinformatics analysis of mouse crush-injured sciatic nerves and found that the lncRNA Pvt1 was overexpressed in Schwann cells after peripheral nerve injury. Mechanistic studies revealed that Pvt1 increased c-Jun expression through sponging miRNA-214. We overexpressed Pvt1 in Schwann cells cultured in vitro and found that the proliferation and migration of Schwann cells were enhanced, and overexpression of miRNA-214 counteracted the effects of Pvt1 overexpression on Schwann cell proliferation and migration. We conducted in vivo analyses and injected Schwann cells overexpressing Pvt1 into injured sciatic nerves of mice. Schwann cells overexpressing Pvt1 enhanced the regeneration of injured sciatic nerves following peripheral nerve injury and the locomotor function of mice was improved. Our findings reveal the role of lncRNAs in the repair of peripheral nerve injury and highlight lncRNA Pvt1 as a novel potential treatment target for peripheral nerve injury.

摘要： Exosome-derived long non-coding RNAs(lncRNAs)are extensively engaged in recovery and repair of the injured spinal cord,through different mechanisms.However,to date no study has systematically evaluated the differentially expressed lncRNAs involved in the development of spinal cord injury.Thus,the aim of this study was to identify key circulating exosome-derived lncRNAs in a rat model of spinal cord injury and investigate their potential actions.To this end,we established a rat model of spinal cord hemisection.Circulating exosomes were extracted from blood samples from spinal cord injury and control(sham)rats and further identified through Western blotting and electron microscopy.RNA was isolated from the exosomes and sequenced.The enrichment analysis demonstrated that there were distinctively different lncRNA and mRNA expression patterns between the two groups.Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)pathway analysis and Gene Ontology(GO)functional analysis were performed to determine the possible involvements of upregulated and downregulated lncRNAs in various pathways and different biological processes,as well as their cellular locations and molecular functions.Furthermore,quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction showed that the expression of five lncRNAs––ENSRN0T00000067908,XR_590093,XR_591455,XR_360081,and XR_346933––was increased,whereas the expression of XR_351404,XR_591426,XR_353833,XR_590076,and XR_590719 was decreased.Of note,these 10 lncRNAs were at the center of the lncRNA-miRNA-mRNA coexpression network,which also included 198 mRNAs and 41 miRNAs.Taken together,our findings show that several circulating exosomal lncRNAs are differentially expressed after spinal cord injury,suggesting that they may be involved in spinal cord injury pathology and pathogenesis.These lncRNAs could potentially serve as targets for the clinical diagnosis and treatment of spinal cord injury.

摘要： 背景:酒精性股骨头坏死与饮酒具有高度的相关性,然而其具体发病机制尚不明确且存在一定的个体差异.目的:构建酒精性股骨头坏死的基因网络图谱,进一步探索酒精性股骨头坏死的潜在发病机制.方法:从广西中医药大学第一附属医院骨二科招募3例酒精性股骨头坏死患者和3名健康志愿者,通过对其外周血进行基因测序筛选具有差异表达的mRNA和lncRNA,通过预测lncRNA-miRNA和miRNA-mRNA的相互作用靶点,使用cytoscape软件构建竞争性内源RNA调控网络.结果 与结论:①通过差异表达分析从酒精性股骨头坏死样本中鉴定出了差异lncRNA 127个、差异mRNA 921个,通过靶基因预测共预测出了205个miRNA及5184个mRNA靶点,最终构建了包含3个lncRNA(SNHG3、MUC19、LINC00476)、5个miRNA(hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-139-5p、hsa-miR-126-3p、hsa-miR-193a-3p、hsa-miR-135a-5p)和11个mRNA(PEX5、ACTR3B、CHMP4B、CSMD1、MTRF1、ZNF3、HTR7、NR5A2、SYT14、CASK、ING5)的ceRNA网络,涉及干细胞分化、炎症反应、神经内分泌、基因多态性等多种生物学过程.②结果表明,通过构建竞争性内源网络筛选出了一系列酒精性股骨头坏死潜在的生物标志物,为进一步研究其分子机制及治疗靶点提供了新思路.

摘要： 背景:激素性股骨头坏死早期很难被发现,其发病机制尚不明确,易被忽视并错过最佳治疗时间,晚期致残率高.研究表明非编码RNA与激素性股骨头坏死的发展相关.目的:总结国内外相关文献资料,综述非编码RNA的表达对激素性股骨头坏死发病的调控机制,进一步了解其发病机制.方法:英文以"miRNA、lncRNA、circRNA、Glucocorticoids、steroid、dexamethasone、osteonecrosis of the femoral head、bone marrow mesenchymal stem cells"为关键词,检索PubMed、Web of Science数据库;中文以"miRNA、lncRNA、circRNA、激素、股骨头坏死、骨髓间充质干细胞"为关键词,检索中国知网、万方、维普数据库,收录非编码RNA与激素性股骨头坏死发病机制相关的文献,排除重复性研究、无参考意义文献,纳入符合标准文献48篇.结果 与结论:①非编码RNA通过调控骨髓间充质干细胞分化、骨细胞代谢、血管内皮细胞生成及脂质代谢的途径参与激素性股骨头坏死的发病过程;②非编码RNA有望成为激素性股骨头坏死临床诊断及治疗预后的生物标志物;③干扰非编码RNA的异常表达或外泌体来源的miRNA,未来或将成为激素性股骨头坏死临床治疗的新策略.

摘要： 长链非编码RNA(lncRNA)一类长度超过200个核苷酸、具有很少或没有编码能力的RNA转录物,可在转录、转录后修饰、RNA编辑、RNA转运和翻译等过程,参与许多细胞过程。近年来lncRNA在眼科中的研究进展迅速,本文主要就lncRNA在眼科疾病的相关研究成果予以简要综述,并展望lncRNA在眼科疾病中的研究前景。

摘要： 慢性阻塞性肺疾病是呼吸系统疾病中的常见病,炎症机制、蛋白酶-抗蛋白酶失衡机制、氧化应激机制、自主神经功能失调等发病机制可能参与慢性阻塞性肺疾病的发生、发展过程。大量研究表明,外泌体lncRNA在慢性阻塞性肺疾病的发展过程中发挥重要作用。本文就外泌体lncRNA在慢性阻塞性肺疾病的发病机制、诊断、治疗中的研究进展做一介绍。

摘要： 利用高通量测序筛选心房颤动(房颤)伴脑卒中患者外周血单核细胞中差异表达的lncRNAs,为从分子水平探讨房颤脑卒中发生发展机制提供实验依据,并寻找预测房颤脑卒中相关生物学标志物.应用高通量测序检测三例房颤伴脑卒中患者和三例房颤患者外周血单核细胞lncRNAs差异表达,进行基因本体论(Gene Ontology,GO)、代谢信号通路(Pathway)分析,建立lncRNAs-miRNAs共表达网络,并进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证.与对照组相比,房颤伴脑卒中患者差异表达301条lncRNA,其中上调143条,下调158条,上调和下调表达差异最大的是LINC01002,HCG18等基因.GO功能分析发现,差异表达基因参与疾病发生发展最主要的生物学过程包括结合、肽交联、高渗反应、内肽酶活性的调节、细胞体积的正向调节等.KEGG分析后发现,差异表达的lncRNA相关信号通路主要涉及免疫系统和炎症等相关.TCONS_00014860,TCONS_00020132,TCONS_00037601,TCONS_00003375,TCONS_00013755是lncRNAs-miRNAs共表达网络中结合节点最多的前五个lncRNAs,hsa-miR-619-5p是共表达网络中与lncRNAs作用最多的节点.qRT-PCR验证LINC01002,HCG18在两组人群中差异表达具有统计学意义.其与房颤相比,房颤伴脑卒中患者外周血存在差异表达lncRNA,与房颤发生脑卒中相关.XLOC_005045,XLOC.006945,XLOC_013107,XLOC.001139和XLOC_004677是共表达网络中结合节点最多的前五个lncRNAs,lncRNA-hsa-miR-619-5p可能在房颤伴脑卒中的发病机制中起到重要作用.同时,LINC01002,HCG18可以作为预测持续性房颤合并卒中的新型生物学标志物.

摘要： 长链非编码RNA(lncRNA)是一类本身不编码蛋白、转录本长度超过200 bp的RNA。lncRNA最初被认为是RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,是一种“噪音”,不具有生物学功能。但近年研究证实,lncRNA参与X染色体沉默、染色体修饰和基因组修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等过程,其调控作用被越来越多研究者关注。多个研究表明lncRNA在机体炎症反应过程中发挥重要作用。作为免疫细胞的巨噬细胞在机体免疫功能发挥和炎症反应过程中居主导地位,本文就lncRNA对巨噬细胞的调控作用及机制进行综述。

摘要： 本发明提供外泌体lncRNA RN7SL5P作为内参基因在胃癌lncRNA检测中的应用，属于生物医学技术领域。具体的，本发明通过高通量深度测序及扩大临床样本表达验证证明，lncRNA RN7SL5P可作为内参应用在胃癌外泌体lncRNAs的检测中，本发明以LncRNA RN7SL5P作为胃癌血清外泌体lncRNAs检测的内参基因，开发了相应的检测试剂盒，该试剂盒检测灵敏度高、特异性高、检测方便，满足诊断胃癌病人的检测需求，经临床验证诊断准确率高，具有良好的实际应用之价值。

摘要： 本发明一方面证实了LINC00173.V1在肺鳞癌中显著高表达且可以作为区分是否患肺鳞癌的工具；另一方面还明确了LINC00173.V1可作为肺鳞癌的预后判断工具。此外，沉默LINC00173.v1的试剂可用于制备抗血管生成剂，尤其适用于肺鳞癌的预防与治疗。以上结果为肺鳞癌的诊疗提供新的策略。

摘要： 本发明提供外泌体lncRNA RN7SL5P作为内参基因在胃癌lncRNA检测中的应用，属于生物医学技术领域。具体的，本发明通过高通量深度测序及扩大临床样本表达验证证明，lncRNA RN7SL5P可作为内参应用在胃癌外泌体lncRNAs的检测中，本发明以LncRNA RN7SL5P作为胃癌血清外泌体lncRNAs检测的内参基因，开发了相应的检测试剂盒，该试剂盒检测灵敏度高、特异性高、检测方便，满足诊断胃癌病人的检测需求，经临床验证诊断准确率高，具有良好的实际应用之价值。

摘要： 本发明提供了一种lncRNA和lncRNA抑制剂的应用及应用其的产品，涉及生物医学工程技术领域。本发明提供的lncRNA，含有SEQ ID NO.1所示的序列，在H2O2处理的HA‑VSMC细胞中表达量增加；而且，lncRNA能够促进小鼠原代血管平滑肌细胞的凋亡，并且能够促进动脉粥样硬化炎症的发生和粥样斑块的大小和数量；而lncRNA抑制剂能够使细胞死亡率降低，经lncRNA抑制剂处理的细胞中抗凋亡蛋白Bcl‑2表达增加。因此，lncRNA可以作为一种新的生物标志物，应用于动脉粥样硬化的诊断和/或预后评估；而与之相应的lncRNA抑制剂，可以作为一种新型的药物用于动脉粥样硬化的预防和/或治疗。

摘要： 本发明提供了一种基于lncRNA‑H19的慢性肾脏病肾功能诊断试剂盒及lncRNA‑H19的应用。该试剂盒包括RNA提取试剂、lncRNA‑H19引物、反转录体系和标准PCR反应体系。本发明通过实验发现lncRNA‑H19在患者血清中的表达情况与慢性肾脏病肾功能进展成正相关，lncRNA‑H19的表达越高，患者的肾功能越好，治疗后效果越好，患者预后越好，提示lncRNA‑H19可作为一种检查标的来辅助对慢性肾脏病肾功能的诊断，因此lncRNA‑H19能够作为慢性肾脏病患者肾功能的诊断的相关指标，可用于制作慢性肾脏病肾功能诊断试剂和诊断试剂盒。

摘要： 本发明属于疾病诊断用生物标志物技术领域，具体涉及乳腺癌相关的LncRNA组合标志物、试剂盒及其应用。本发明筛选出C6orf99、LINC00987、SIAH2‑AS1、LINC01010和ELOVL2‑AS1作为组合标志物形成的乳腺癌预后模型，根据模型中位风险值，将BRCA患者分为高、低风险组，高危组的风险分值更高，生存率低；5个免疫相关LncRNA与临床特征具有相关性，尤其是C6orf99，它在乳腺癌晚期的表达明显增加，LINC00987、SIAH2‑AS1、LINC01010和ELOVL2‑AS1的表达水平下降，与乳腺癌的恶性发展有关。

摘要： 本发明公开了免疫相关的lncRNA表达谱预测小细胞肺癌辅助化疗获益及预后的应用。本发明所要保护的一个技术方案是八种lncRNA作为标志物在制备预测小细胞肺癌患者的预后产品和/化疗获益的产品中的应用。八种lncRNA包括ENOX1‑AS1,AC005162,LINC00092,RPL34‑AS1,AC104135,AC015971,AC126544和AP001189。实验证明，基于八种lncRNA基因表达谱的风险值预测模型可以有效对小细胞肺癌的预后和辅助化疗获益进行预测。该发明可为未来化疗在SCLC患者中的临床应用提供参考依据，将有助于提高临床小细胞肺癌的治疗疗效。

摘要： 本发明涉及一种可用于诊断和治疗变应性鼻炎的lncRNA，具体的本发明公开了一种lncRNAFAM239A:31变应性鼻炎患者外周血单核细胞PBMC中过表达，该过表达能够促进酪氨酸磷酸酶SHP2表达，进而促进Th2细胞分化，同时阻滞Th1和Treg细胞分化，促进变应性鼻炎中炎性反应。降低或抑制SHP2的表达，能够减缓lncRNAFAM239A:31过表达对下游Th2、Th1、Treg细胞的调控作用。该发明在临床上为利用lncRNAFAM239A:31和SHP2来诊断和治疗变应性鼻炎，以及提供药物靶点方面提供应用价值。

摘要： 本发明公开了lncRNA高表达抑制脐带间充质干细胞衰老的用途。体外培养的包括UC‑MSCs在内的MSCs易衰老特性制约着其临床发展与应用。D‑半乳糖诱导是构建体外衰老细胞模型的经典方法。本发明研究结果发现，lncRNA‑1708高表达的UC‑MSCs具有相对较强的抗衰老活性，同时还具有较强的体外增殖活性。因此，可以通过提高lncRNA‑1708表达水平的方法体外培养人脐带间充质干细胞抑制其衰老。

摘要： 一种重组腺病毒ADV‑lncRNA Gm44275及其构建方法和应用，涉及诱导分娩领域。该重组腺病毒ADV‑lncRNA Gm44275是通过在lncRNA Gm44275序列中添加CBH Promoter序列和绿色荧光标签序列构建lncRNA过表达载体，再将lncRNA过表达载体与腺病毒表达载体进行同源重组，经酶切、转染、纯化、浓缩后获得的。该重组腺病毒ADV‑lncRNA Gm44275能够应用在制备具有诱导动物分娩功能药品中。本发明能够促进母畜提前分娩，不会影响母体健康，配方更有普适性，对于各种动物皆使用，不会在动物体内造成激素残留，诱导分娩效果更稳定，受个体差异影响更小。