地理变异

摘要： 为了探究古北界啄木鸟属(Dendrocopos)鸣声的地理变异,我们通过xeno-canto.org网站收集了广泛分布于古北界的啄木鸟属3种啄木鸟和黑啄木鸟(Dryocopus martius)的鸣声数据。利用音频处理软件Audacity与声谱分析软件Wavesurfer对收集到的1353条啄木鸟鸣声数据进行鸣声参数数据的提取。其中大斑啄木鸟(D. major)鸣声数据664条,白背啄木鸟(D. leucotos)鸣声数据178条,叙利亚啄木鸟(D. syriacus)鸣声数据208条和黑啄木鸟鸣声数据303条。利用Kruskal-Wallis检验,对不同地区啄木鸟属3种啄木鸟的鸣声地理差异进行分析,结果显示:古北界大斑啄木鸟、白背啄木鸟、叙利亚啄木鸟的鸣声特征均存在显著的地理差异。分布于亚洲地区的大斑啄木鸟、白背啄木鸟、叙利亚啄木鸟的鸣声音节持续时间最长,最高频率最高。北欧地区白背啄木鸟、叙利亚啄木鸟的鸣声间隔时间最短,即鸣声较其他地区急促。采用系统聚类分析方法,比较古北界啄木鸟属不同地区鸣声的相似性,结果显示:亚洲地区的3种啄木鸟鸣声特征与欧洲地区的鸣声特征均存在着地理差异。西欧地区的和北欧地区的大斑啄木鸟鸣声特征最相近,与亚洲地区和中欧地区的鸣声差异最大。亚洲地区和中欧地区的叙利亚啄木鸟鸣声特征相似,与东欧和南欧地区的鸣声存在着明显地理差异。另选取黑啄木鸟鸣声作为外群,与啄木鸟属鸣声特征比较,结果显示:与黑啄木鸟鸣声特征相比,啄木鸟属内具有强烈的鸣声相似性。在啄木鸟属中,大斑啄木鸟和叙利亚啄木鸟鸣声特征相似,与白背啄木鸟聚成两类。通过对啄木鸟鸣声地理变异一般规律的研究,并与形态学、分子生物学等综合分析,将更有利于对啄木鸟的生物地理变异进行探究与应用。

摘要： 长白山中华蜜蜂是栖息在长白山地区的珍稀特有蜜蜂种群,具有优良的生物学特性和产蜜能力。目前,长白山中华蜜蜂已濒临灭绝,迫切需要加大对长白山中华蜜蜂的保护力度。文章介绍了我国长白山中华蜜蜂种群的生存状态,针对长白山地区中华蜜蜂的形态特征和地理变异进行研究,以期为我国长白山地区中华蜜蜂种群保护研究提供有效参考。

摘要： 为探究不同种源黄连木种子间的形态多样性及地理变异规律,对采自河北、河南等13个种源黄连木种子的形态指标和品质指标进行了测定。结果表明,不同种源黄连木种子的纵径、横径、横纵径之比、种子含水量、千粒重、发芽率、发芽势、发芽指数、活力指数均存在显著性差异(P<0.05)。采用主成分分析和隶属函数法对13个种源黄连木种子进行综合评估,其中红鹤种源和南果种源的综合评价更高,而白芟种源和曲阳种源种子则较差,二者的分析结果保持一致。聚类分析表明,当欧式距离大约为7.0时,13个黄连木种子可以分为3大类,各大类的种子性状产生了较大的差异。相关性分析表明,随着降水量的增加,种子的纵径呈逐渐减小的趋势;而随着年均温度的升高,黄连木种子的发芽势和横径都呈现增高的趋势。综上所述,不同种源黄连木种子性状间的差异不仅是由丰富的遗传分化引起的,同时还受到降水量、温度等环境因子的影响。

摘要： 树皮是树木的重要组成器官之一,在树木生长发育过程中起着重要的生理生态功能。从树皮起源与演化过程、表观形态地理学和生理生化地理学三个方面进行综述:1)推测树皮起源于古生代泥盆纪,已有研究显示可通过树皮表观形态的变异来推测其进化趋势;2)树皮形态和生理生化功能的地理变异由生境条件和气候因子的差异引起;3)物种为适应当地的生态环境,长期在自然选择压力的作用下进化出相应的生理生态功能,进而导致外部表观形态发生变异。为探究树皮的时空演化、树种的遗传改良提供了线索和依据,同时也为深入研究树皮随地理格局变异的规律提供了参考。

摘要： 美国白蛾原产北美,1979年首次在我国辽宁丹东地区发现,目前已扩散至多个省份,并有进一步扩散的趋势。由于其寄主范围广,适应能力强,危害严重,给我国林业生产造成了重大损失。为探明美国白蛾入侵我国后自北向南扩散过程中,卵、蛹及成虫体型和成虫繁殖能力的地理变异,南京林业大学林学院研究人员于2019年5-6月,采集辽宁省凤城市、天津市武清区、山东省商河县、江苏省淮安区4个地理种群的美国白蛾高龄幼虫,带回实验室后于室外自然环境条件下继续饲养,待幼虫化蛹和成虫羽化后,分别检测了4个地理种群美国白蛾卵、蛹和成虫体型大小及成虫怀卵量与采集地纬度的关系。

摘要： 以南方红豆杉[Taxus wallichiana var.mairei (Lemée et H.Lév.)L.K.Fu et Nan Li] 18个天然居群为研究对象,对叶片的5个表型性状和3个氮磷化学计量指标进行了比较,对各性状和指标及地理-气候因子间的相关性进行了分析,并基于叶片表型性状对18个居群进行了聚类分析.结果 显示:南方红豆杉的叶长、叶宽、叶面积、叶周长和叶宽长比的变幅分别为2.32～ 3.00 cm、0.33～ 0.48 cm、0.64～ 1.12 cm2、5.43～7.03 cm和0.14～0.17;各性状的变异系数为12.79％ ～ 29.56％,以叶宽长比的变异系数最大,且在居群间和居群内差异极显著(P＜0.01).叶片的氮含量、磷含量和氮磷比的变幅分别为14.30～20.83 9·kg-1、0.96～1.61 9·kg-1和10.62～ 22.28;各指标的变异系数为11.13％ ～ 20.90％,以氮磷比的变异系数最大,且在居群间差异极显著.5个表型性状在居群内的方差分量百分比均值(51.54％)明显大于居群间(22.88％).叶长与叶宽长比无显著相关性,其他表型性状间均极显著或显著(P＜0.05)正相关;氮磷比与氮含量显著正相关,与磷含量极显著负相关;氮磷比与叶长显著负相关,与叶面积和叶周长显著正相关;叶长、叶面积和叶周长与经度显著负相关,叶宽长比与最热月最高温极显著负相关.在欧氏距离15处,18个居群可聚为2类,其中,第1类的居群大部分位于浙江省和福建省,第2类的居群大部分位于江西省.综合分析结果表明:南方红豆杉天然居群叶片的表型性状和氮磷化学计量指标存在明显的地理变异,且大多为随机变异;叶长、叶面积和叶周长在地理空间上呈现以经度为主的单一变异模式;随经度增大叶片趋于短小,叶片氮磷比越大叶片越宽大;叶片表型性状的变异主要来源于居群内,是遗传和环境共同作用的结果.

摘要： [目的]阐明华重楼主要药用成分的地理变异规律,为华重楼种质资源利用和原料林基地选址提供科学依据.[方法]以我国8省份10个种源华重楼为材料,对其根茎总酚酸、总黄酮、重楼皂苷Ⅰ、Ⅱ、Ⅵ和Ⅶ含量进行了测定、分析.[结果]不同地理种源间华重楼根茎总酚酸、总黄酮、重楼Ⅰ、Ⅱ、Ⅵ和Ⅶ含量差异均达极显著水平.不同种源华重楼根茎中总酚酸含量变异幅度为1.718～5.436 mg·g-1;总黄酮含量变异幅度为0.780～1.457 mg·g-1;重Ⅰ、Ⅱ、Ⅵ和Ⅶ含量变异幅度为0.008～2.106、0.000～0.646 mg·g-1、0.000～0.521和0.000～9.170 mg·g-1;华重楼根茎中总酚酸含量与原产地海拔、皂苷Ⅱ与1月均温呈中度正相关关系,总黄酮含量与全年日照时数、皂苷Ⅶ与海拔呈中度负相关关系.总皂苷与海拔间呈高度负相关关系,皂苷Ⅱ与年均温、皂苷Ⅵ与7月均温间均呈高度正相关关系;华重楼根茎中总酚酸与总黄酮含量、总黄酮与皂苷Ⅰ含量、皂苷Ⅰ与皂苷Ⅱ含量呈中度正相关关系,总皂苷与皂苷Ⅶ含量呈高度正相关关系.聚类分析表明,10个种源可以划分为3个类群,低酚酸、低黄酮和高皂苷类群,高酚酸、高黄酮、低皂苷类群和中酚酸、中黄酮、中皂苷类群.[结论]广西桂林为高酚酸和高黄酮优良种源,安徽祁门为高皂苷优良种源.

摘要： 通过研究道地药材唐古特大黄(Rheum tanguticum Maxim.ex Balf.)四种功效组分的地理变异,以及与多层次气候因子间的响应关系,揭示唐古特大黄不同化学型形成的生态学机制.运用聚类方法研究唐古特大黄成分地理变异的空间规律,并利用相关系数法分析气候因子与唐古特大黄成分的响应关系.结果 表明:唐古特大黄功效组分存在明显的地理变异.青海和甘肃地区的唐古特大黄属于结合蒽醌化学生态型;而四川所产唐古特大黄为游离蒽醌化学生态型.不同时间尺度气候因子与唐古特大黄组分间的响应特征为:结合蒽醌类物质与年均温呈强负相关,多酚类物质与年均温和年降水为负相关,而与年均日照时数为正相关;结合蒽醌类物质与最冷季节温度是强负相关,多酚类物质与最冷季节温度和最湿季降雨量呈强负相关;月均温和月均日照对结合蒽醌类物质和多酚类物质影响大,其中1月至6月平均气温和9月至12月平均气温与蒽醌类物质呈强负相关,多酚类物质与5月日照量、6月日照量和7月日照量表现出强正相关.地区间的温度和日照量差异是唐古特大黄不同化学型形成的气候原因.最冷季的低温和最湿季的日照量是影响唐古特大黄品质的关键气候因子和主要时间窗口.温度浮动大,日照量高且降水量少的低温区域有助于结合蒽醌类和多酚类物质的形成和累积.

摘要： 目的:对不同产地的山茱萸总皂苷和总环烯醚萜苷进行含量测定,研究不同产地地理因子对其含量影响及之间的相关性,为山茱萸优良产区筛选及质量控制提供相关的理论依据.方法:采用分光光度法和高效液相色谱法对15个产地的山茱萸总皂苷和总环烯醚萜苷含量进行测定,并利用SPSS 19.0软件分别对其含量与产地地理因子进行相关性分析和聚类分析.结果:15个产地的山茱萸总皂苷和总环烯醚萜苷含量变化幅度分别为13.55 mg/g～26.65 mg/g、23.05 mg/g～32.68 mg/g,不同产地之间的活性成分含量差异显著,其中河南西峡样品中总皂苷和浙江淳安样品中总环烯醚萜苷含量高;相关性分析发现总皂苷的含量和产地与海拔呈现极显著的正相关,和经度呈现显著的负相关,环烯醚萜苷含量与环境因子的相关性不显著;聚类分析结果显示,总皂苷与总环烯醚萜苷在东西部产地含量存在明显差异,表现为西高东低的趋势.结论:不同产地的山茱萸总皂苷和总环烯醚萜苷含量不同,存在明显的区域特征、与海拔和经纬度呈现相关性,本研究为山茱萸选择优良的种植产地提供理论支持.

摘要： [目的]研究不同地理种源间高山栲种子性状特征及其与地理、气候因素间的变化规律,探究高山栲种群的生态地理分布规律,为高山栲优良种源的早期选择提供科学依据.[方法]以高山栲主要自然分布区域内9个地理种源的高山栲种子为研究对象,在每个地理种源内选取15棵健康的母株,去除壳斗后每株选取10粒正常、饱满的种子,测定种子的种高、种宽、种形指数、单粒鲜质量、单粒干质量和千粒质量等指标,并进行方差分析、回归分析和聚类分析.[结果]在9个高山栲地理分布区域内,种子质量性状的稳定性显著低于种子形状指标(P<0.001).高山栲平均种高为11.24 mm,平均种宽为10.45 mm,平均种形指数为1.08,平均单粒鲜质量为0.97 g,平均单粒干质量为0.61 g,平均千粒质量为974.34 g.种子性状在不同种源间均存在极显著差异(P<0.001),其中以剑川种源的种子形状与质量指标最高,剑川种源的平均种高为13.66 mm,平均种宽为12.52 mm,平均单粒鲜质量为1.55 g,平均单粒干质量为0.97 g,平均千粒质量为1551.65 g.各种源高山栲种子性状均随着经度的减小和海拔的增加呈现不断增大的趋势,且与年均温度(MAT)和年均降水量(MAP)间存在极显著负相关关系.[结论]受地理和气候因素的影响,不同种源间高山栲种子性状存在显著差异,该研究对于开展高山栲优良种质资源的筛选工作及理解高山栲的地理分布格局具有重要意义.

摘要： 利用18个多花黄精种源为材料,研究了多花黄精农艺性状和药用有效成分在种源水平上的遗传变异规律.研究结果表明：方差分析结果表明,除根茎长外,株高、地径等农艺性状及其根茎多糖含量在多花黄精不同种源间均达到显著或极显著差异.相关分析结果表明,多花黄精株高、地径和叶面积与根茎长、根茎粗和根茎鲜重均呈正相关,但其根茎多糖含量与株高、地径、根茎粗均呈负相关,且多花黄精不同种源间没有明显的地理变异模式.遗传变异分析结果表明,除株高外,多花黄精其他农艺性状与药用有效成分含量的遗传方差均小于其环境方差,且除株高、根茎多糖含量等性状受到中等程度以上的遗传控制外,其他性状遗传力均比较低.同时,多花黄精除株高的遗传变异系数比环境变异系数稍大外,其它性状的遗传变异系数均小于其环境变异系数.运用隶属函数法综合筛选出石门壶瓶山、沅陵火场、安化仙溪、溆浦低庄和恩施咸丰等5个优良种源.

摘要： 苦楝分布广,用途多.为了更准确定地掌握苦楝的地理变异及其规律,对17个省份的70个苦楝种源的果核和种子的18个性状进行了观测和分析,结果表明:苦楝不同种源间在果核和种子表型性状上存在显著差异,大多数性状的重复力大于85％,其中种子百粒重、果核宽的种源重复力高,达到98％以上,其次是果核百粒重、种子大小性状,而棱粒比、果核果形系数b的重复力最小,分别为74.56％、49.14％.部分性状的种源变异存在明显的地理趋势.即:由东向西,果核的宽度和质量、种子宽度、核果皮厚度、果核单果棱数的数值有增大的趋势;由南向北,果核长度、种子宽度、种子质量、果核单果棱数和果核皮系数的数值增大的趋势,种子趋于粗短的椭圆形,但果核皮凹凸地理趋于不明显;海拔高度由低到高,果核和种子宽度、果核质量、果核皮厚度、果核单果棱数的数值趋大,果核趋于圆形,种子趋于粗短的椭圆形.这种地理变异有一定气候生态学基础.即:随年均温的升高,核果皮厚度、果核单果棱数增加,果核和种子由圆形趋向椭圆形,果核皮棱纹凹凸程度趋于不明显;随无霜期的延长,种子的宽度、质量和果核单果棱数增加,种子由细长型趋向粗短形;随年均日照的增加,果核质量及果核单果粒数增加,种子由圆形趋向椭圆形,果核皮棱纹凹凸程度地理趋于不明显.根据苦楝果实的18个性状指标的聚类分析,可将70个种源划分为8类,种源类群间性状差异也显著.

摘要： 鸟类鸣唱是研究鸟类鸣声学习和文化传承的良好素材,在研究鸟类的扩散、物种进化方面具有重要作用.本论文将青海门源三个地点的赭红尾鸲鸣声进行比较,研究鸣唱的地理变异.同时对低海拔地区的西宁赭红尾鸲和高海拔门源地区赭红尾鸲的鸣唱进行比较以研究海拔高度这一生态因子对鸣唱特征的影响.2009、2010年录制了青海门源中国科学院海北站、马场、青石嘴和西宁市赭红尾鸲繁殖早期的鸣唱,用Avisoft-SASLab Pro声谱分析软件进行鸣唱参数的分析测定.结果表明:青海门源三个地点赭红尾鸲的鸣唱音节形态、数目和音节成份具有明显差异.三个地点的鸣唱随着间隔距离的增大呈现出一定的地理梯度变异.海北站的鸣唱最为简单、青石咀的最为复杂,赭红尾鸲鸣声的复杂性可能与局部密度相关.同时赭红尾鸲鸣唱的长度受海拔高度的影响,低海拔的西宁地区赭红尾鸲鸣唱的长度大于高海拔的门源地区,差异极显著.

摘要： 鸟类鸣唱的主要功能是吸引配偶和维持领域.地理种群间自然选择、性选择压力的差异、种群历史等作用能引起地理种群间的鸣声特征发生分化,在一定程度上影响选型交配,对种化过程产生潜在的影响.强脚树莺是中国南方广泛分布的灌丛鸟类,其鸣声响亮,鸣声结构简单.分析了26个强脚树莺种群、381只个体的鸣声地理变异格局,并探讨了空间距离、形态差异等因素对鸣声分化的影响.本研究发现不同种群鸣唱句型存在阶梯状变化趋势,可将强脚树莺划分为四个方言区.通过比较鸣声差异与地理距离发现,鸣声分化与地理距离有较大的相关性,未发现形态差异对鸣声分化有显著影响.为探讨鸣声地理变异格局与物种系统发育的关系,采集了22个地理种群、232只强脚树莺的组织样品进行了研究.利用线粒体cytb和ND2基因和核基因ODC基因,对种群间的遗传距离和系统发育关系进行了研究.系统发育关系重建表明强脚树莺可分化为3个进化支,davidiana亚种与robustipes亚种共同构成一个进化支,pallida亚种和orties亚种各为一个进化支,且pallida亚种位于系统发育树的基部,是较古老的进化单元.研究结果表明fortipes亚种与davidiana-robustipes组之间遗传距离较大,说明两个进化支之间可能经历了长期的隔离.robustipes亚种与davidiana多数种群间也有显著的遗传差异，但远小于两者与forcipes之间的遗传差异，说明两者虽有一定分化但亲缘关系较近，历史上可能有一定程度的基因交流或是两者间分化时间较短。鸣声研究中发现鸣声句型多样性和复杂性存在由西向东降低的趋势，推测可能是由于该物种在喜马拉雅地区起源，并在向东扩张过程中的奠基者效应导致的鸣声多样性的降低。

摘要： 以12个黑木相思种源的一年生枝条为材料,测定不同低温处理下叶片的相对电导率,利用Logistic方程计算各种源的半致死温度(LT50),应用相关分析和主成分回归分析法研究耐寒性的地理变异。结果表明：种源耐寒能力大小依次为M5(NSW)>3(SA)>7(NSW)>2(VIC)>M4(QLD)>16(NSW)>M2(QLD)>M1(QLD)>M6(QLD)>M3(NSW)>1(QLD)>6(NSW),LT50随纬度升高而降低,影响LT50大小的最主要因素是温度(一月均温、年均温、七月均温)及相对湿度.通过聚类分析,将12个种源按LT50大小分成南北两大类群。

摘要： 本研究在掌握了蒙古栎的起源与分布情况并的基础上。选择了黑龙江省大兴安岭的加格达奇、五大连池、五营、带岭、沾河、金山屯、亚布力、苇河、五常、绥阳、江山娇林场、吉林的长白、四平和九台、辽宁千山和庄河、北京平谷、山东烟台、朝鲜金刚山19个种源;采用方差分析、聚类分析等统计方法和分析，详细探讨了蒙古栎不同种源的果实、纤维长度、叶与芽形态的地理变异情况，从而为栎类的种群生态学和蒙古栎的种源实验研究提供科学的依据。

摘要： 滞育(Diapause)是昆虫受到环境条件信号诱导引发的发育暂时静止状态的一种生活史策略.滞育通常发生在昆虫特定的生长发育阶段,主要表现在形态发育的暂时中止、生理代谢活动的显著降低和通常伴随的对不利环境条件抗逆能力的增强.近年来，昆虫滞育生理生态研究课题组围绕昆虫滞育的光温反应、滞育光周期钟和光周期时间测量机制、滞育地理变异、滞育遗传性等方面开展了系统研究工作。

摘要： 本研究对位于海口市东山林场试验基地的2年生小桐子种源的种实特征进行了调查,主要研究了小桐子种实的遗传变异和优良种源的选择.种源来源包括泰国、越南以及我国云南、四川、广西、贵州、海南等43个种源.通过对小桐子种实的单果均重、百粒重、出仁率、出籽率、种子大小、种子含油量等性状的分析,结果显示,小桐子种源间种实呈现显著的地理变异趋势,单果均重、百粒重和种子体积与纬度呈显著正相关,与经度呈显著负相关,尤其以单果均重和种子百粒重存在极显著的地理变异;选出了10号(云南南涧)、17号(四川雷波)、1号(云南怒江)、15号(四川会东)等4个优良种源,并对这些优良种源的利用做出了评价.

摘要： 在秋季迁徙途中,很多美国东部的鸣禽不停歇地直接飞越墨西哥湾,而美国西部的鸣禽则会飞经可以选择更多迁徙停歇地的区域.假设,为了提高适合度,在迁徙途中进化而形成的适应性行为(即迁徙停歇生态)应该随着地理和生态条件的不同而不同.认为在秋季迁徙中,幼鸟相对缺少经验,在飞行能量的利用、换羽、避免捕食和导航等方面的表现不如成鸟,这也会导致东部和西部种群在迁徙停歇生态上存在差异.收集了在阿拉巴马州墨西哥海湾沿岸和新墨西哥州格兰德河中部同期的秋季迁徙数据,分析物种间和物种内的年龄结构、体重、脂肪积累和体重变化等迁徙停歇生态指标在不同地理条件下的变异.结果表明，同属物种平均年龄比例在两个地点相似(墨西哥湾1.9，格兰德河1.5)，同年龄的个体的体重差异较小，这与在两个地点均捕获较多数量物种的地点间体重比较的结果不一致。本研究结果证实了同一物种在采用不同路线迁徙时己经适应了各自特殊的地理条件。沿东部迁徙的鸟积累大量脂肪来适应无停歇飞越墨西哥湾的模式，而利用格兰德河的鸟并不积累大量的脂肪而更倾向于利用沿途的食物资源。这种模式无论对幼鸟还是成鸟都是基本一致的。进一步讨论了此结果对于保护这些物种以及对迁徙停歇地管理的作用。

摘要： 鸟类鸣唱主要功能是吸引配偶和维持领域,由于性选择、种群历史、鸣唱学习、形态差异等原因,不同种群、个体间的鸣声可能会发生分化.强脚树莺(Cettia fortipes)广布于中国南部,是常见的灌丛鸟类,繁殖期雄鸟领域性非常强,鸣唱简单、洪亮,非常适于作为鸣唱研究的模型动物.本工作从地理变异、个体差异、句型功能等方面分析了强脚树莺鸣唱的分化.基于线粒体cytb和ND2基因和核基因ODC基因,对地理种群的系统支持对鸣长格局的预测.rn 基于强脚树莺的鸣唱，对宽阔水保护区的20只和董寨保护区的139只雄鸟进行了个体识别研究，发现每个个体的鸣唱在整个繁殖季和年际间具有很高的稳定性，不同个体的鸣唱差异非常显著。分别用alpha句型和beta句型去识别个体，正确率均超过98%。对董寨强脚树莺种群的模拟分析还表明，基于鸣长识别个体的正确率随着变量数的增多而上升。利用物理标记存在捕捉、再发现难度大，且会对鸟类造成一定的影响等问题，而基于鸣唱标记鸟类的具有非损伤、低干扰、易操作的特点，在鸟类监测等研究中有重要的应用前景。同时强脚树莺自身也能识别个体间鸣唱的差异，在亲一敌效应的鸣声识别实验中，强脚树莺更多靠近播放陌生者鸣唱的音箱，表现出强烈的攻击行为。强脚树莺对陌生者的入侵反应更激烈，符合亲敌效应的预测。利用强脚树莺鸣唱个体性的特征，还尝试开展了通过录音矩阵来定位个体和确定目标个体的活动区的实验。alpha句型和beta句型是强脚树莺鸣唱中最常用的两种句型。这两种句型在自发鸣唱和诱发鸣唱中使用的比率无显著的差异，回放诱发的反应也无显著差异。表明与其他已经报道的树莺属鸟类不同，强脚树莺的alpha句型和beta句型在保卫领域的功能上是等同的。

摘要： 本发明公开了基于变异系数的地理空间区域数据多尺度可视化方法。本发明方法首先利用空间相似性将地理空间区域数据进行层次聚类，形成层次结构；然后利用变异系数对层次结构中每个聚类的属性分布进行估计，并依据其变异系数的值进行最优尺度划分，以同时呈现变异系数较低聚类的多尺度可视化。此外，从变异系数和信息熵两方面进行多尺度可视化结果的评估与定量比较，并通过雷达图的使用，从形状方面增强可视化差异的视觉表现，进而直观地评估和比较本多尺度可视化方法。本发明方法实现了一个用于地理空间区域数据的多尺度可视化模型，使用户能够同时可视化地探索原始地理数据的全局特征和细节特征，并深入地了解地理空间区域数据中的潜在特征。

摘要： 本发明公开了一种基于半变异函数的地理空间点数据采样方法。本发明方法首先利用半变异函数，捕捉地理空间点数据的地理统计特征，并在采样过程中实时动态统计采样前后半变异函数差异；然后以差异最小化为目标，驱动模拟退火优化算法，对Z‑order采样生成的初始采样点进行替换，实现地理统计特征的保持，采样结果既保持了地理空间点数据的空间分布，又提高了属性插值准确性。本发明方法从空间分布和属性插值两方面进行采样结果的可视化评估与定量比较，通过等高线图增强了采样前后差异的视觉表现。本发明实现了一个用于大规模地理空间点数据的采样模型，使用户能够轻松地通过采样点还原原始数据特征，可视化地探索和分析地理空间。

摘要： 本发明公开了一种基于半变异函数的地理空间点数据采样方法。本发明方法首先利用半变异函数，捕捉地理空间点数据的地理统计特征，并在采样过程中实时动态统计采样前后半变异函数差异；然后以差异最小化为目标，驱动模拟退火优化算法，对Z‑order采样生成的初始采样点进行替换，实现地理统计特征的保持，采样结果既保持了地理空间点数据的空间分布，又提高了属性插值准确性。本发明方法从空间分布和属性插值两方面进行采样结果的可视化评估与定量比较，通过等高线图增强了采样前后差异的视觉表现。本发明实现了一个用于大规模地理空间点数据的采样模型，使用户能够轻松地通过采样点还原原始数据特征，可视化地探索和分析地理空间。

摘要： 本发明公开了基于变异系数的地理空间区域数据多尺度可视化方法。本发明方法首先利用空间相似性将地理空间区域数据进行层次聚类，形成层次结构；然后利用变异系数对层次结构中每个聚类的属性分布进行估计，并依据其变异系数的值进行最优尺度划分，以同时呈现变异系数较低聚类的多尺度可视化。此外，从变异系数和信息熵两方面进行多尺度可视化结果的评估与定量比较，并通过雷达图的使用，从形状方面增强可视化差异的视觉表现，进而直观地评估和比较本多尺度可视化方法。本发明方法实现了一个用于地理空间区域数据的多尺度可视化模型，使用户能够同时可视化地探索原始地理数据的全局特征和细节特征，并深入地了解地理空间区域数据中的潜在特征。

摘要： 作为本发明的一个方式，进行以下的分析，使对每个碱基种类进行了标记的分析对象的核酸样本进行电泳，检测每个碱基种类的标记信号，生成检测强度的波形数据，对每个碱基种类的上述波形数据的各峰值位置选择其他的峰值位置，计算各峰值位置的信号强度相对于选择出的其他峰值位置的信号强度的相对信号强度，在各峰值位置对分析对象的核酸样本的相对信号强度和已知的核酸样本的相对信号强度进行比较，进行与核酸样本的碱基排列坐标位置的各碱基种类的存在相关的分析。由此，实现高灵敏度、高精度地取得与作为目标的基因区域中存在的微量的基因变异相关的信息。

摘要： 公开了一种用于验证胚胎中基因组变异区域的方法。胚胎测序数据由一个或多个处理器接收。接收的胚胎测序数据由一个或多个处理器与参考基因组比对。一个或多个处理器在比对的胚胎测序数据中识别基因组变异区域。由一个或多个处理器在已识别的基因组变异区域中对许多单核苷酸变异(SNV)进行计数。通过一个或多个处理器，将所识别的基因组变异区域中SNV的计数数量对应于已识别的基因组变异区域的参考区域的SNV基线计数进行归一化，以生成基因组变异区域的归一化SNV密度。如果所识别的基因组变异区域中的归一化SNV密度满足公差标准，则由一个或多个处理器验证所识别的基因组变异区域。

摘要： 本发明涉及特定计算模型的计算机系统相关技术领域，提出了面向并行变异算子的顽固变异体测试数据生成方法及系统，方法包括如下步骤：确定变异体顽固性的评价指标，对待测试程序的变异体进行顽固性判定，得到顽固变异体；根据变异通信语句之间的占优关系，将得到的顽固变异体进行初次分组；按照变异语句与待测试程序的输入参量的相关性，将初次分组后的顽固变异体进行再分组；根据再分组后的顽固变异体构建测试数据生成模型，基于集合进化，设置与杀死变异体相关的适应值函数，求解测试数据生成模型，生成能够杀死顽固变异体的测试数据。本发明能够对并行变异算子引发的变异体顽固性进行判定，并生成杀死顽固变异体的测试数据，提高测试效率。

摘要： 细胞群体的单细胞分析揭示了单个细胞的细胞基因型(例如，单核苷酸变体和拷贝数变异)和表型(例如，蛋白质表达)。在一种情况下，可以根据单个细胞的相应基因型和表型对它们进行分类。在一种情况下，群体中所有细胞的基因型和表型为鉴定细胞亚群提供信息，从而揭示群体内异质性。细胞亚群的鉴定为改善特别是在疾病诸如癌症的情况下对细胞生物学的理解提供信息，并且进一步为更好地设计诊断剂和治疗剂提供信息。

摘要： 对细胞群体的单细胞分析揭示单个细胞的细胞基因型。因此，描述了用于对多个细胞进行单细胞分析以确定单个细胞的细胞基因型的方法。总体上，还描述了单细胞分析方法，其涉及靶向DNA‑seq以产生源自基因组DNA的序列读段，所述序列读段用于确定细胞基因型。所述方法还包括通过分析不同类型的细胞突变，例如短序列突变(例如SNV)与结构变体(例如CNV)的组合，确定细胞基因型，特别是区分异源细胞群体中的基因型。还描述了用于进行所述方法的试剂、材料和试剂盒。细胞亚群的鉴定为改善特别是在疾病诸如癌症的情况下对细胞生物学的理解提供信息，并且进一步为更好地设计诊断剂和治疗剂提供信息。

摘要： 一种用于表征从基因组样品中鉴定的变异体的变异体表达状态的方法(100)，包括：(i)获取(110)基因组样品的DNA测序数据；(ii)获取(110)基因组样品的RNA测序数据，其中所获取的RNA测序数据还包括每个变异体的表达数据；(iii)将比对DNA和RNA测序数据合并(130)成合并比对；(iv)相对于参考基因组来鉴定(140)多个变异体以生成一组变异体；(v)表征(150)至少多个变异体中的每个变异体的RNA编辑和/或表达状态，其中表达状态包括多个等位基因特异性表达分类中的一个等位基因特异性表达分类，多个等位基因特异性表达分类包括变异体的替代等位基因的表达信息和变异体的参考等位基因的表达信息(如果有的话)；以及(vi)生成(160)包括变异体的所表征的表达状态的报告。