基因识别

摘要： 魏晋时期作为胡服“汉化”与汉服“胡化”的重要交融期,同时也是中华文化认同构建的关键时期,因此对于魏晋服饰文化的研究与传承对于中华民族文化基因的构建具有极其重要的意义。本文以魏晋时期服饰为载体,探究其文化基因构建的意义,并深入探讨魏晋服饰文化基因的提取方法,随后揭示了魏晋服饰文化基因提取背景下的设计应用领域。研究结果表明文化基因理论有助于传承传统服饰文化,通过应用到设计领域中更能凸显产品的个性化和人文化,进而有效提升魏晋文化的传承以及文创产品的艺术文化品位。

摘要： 产业共性技术创新的阶段性失败困境及潜在挽救价值使得失败挽救具有一定的必要性与可行性。然而,挽救实施前,需要界定挽救的技术范围、甄选挽救的潜在价值。为此,从技术范围与潜在价值两个层面,设计产业共性技术创新失败挽救对象甄选体系。首先,通过共性技术基因识别,刻画挽救的技术范围。其次,通过AHP-模糊灰色综合评价法结合价值评估体系,实现挽救的价值筛选。最后,基于生物医药行业实际案例,验证甄选体系的有效性,为挽救对象的有效选择提供实际应用方案。

摘要： 文化基因的研究正在从抽象的概念借译转向具象的基因要素识别萃取。侗族刺绣具有纹样、技艺、材质和结构等多种基因,它们能被识别与萃取。这些文化基因包含了侗族刺绣最基本的文化内涵,也体现了侗族刺绣的风格与特点。以岩洞村侗族刺绣为例,在识别、萃取岩洞村侗族刺绣的文化基因之后,我们初步构建岩洞村刺绣文化基因结构二维模型,建立其文化基因表达系统模型,在此基础上能够为岩洞村侗族刺绣在众多的刺绣品辨别中提供参考。以岩洞村为例挖掘刺绣的文化基因,为中华传统文化基因库的建设提供一些案例,进而推动各民族共享的中华文化符号和中华民族形象的树立和突出,增强各族群众对中华文化的认同,铸牢中华民族共同体意识。

摘要： 生物信息学是一门对基因组学和蛋白质组学进行研究的新兴学科,是生物学、计算机科学、信息工程和统计学的综合交叉学科。在眼科生物基因研究中,角膜、晶状体、房水、玻璃体和视网膜因富含大量的生物信息,是理想的生物信息学研究对象。基因组学检测技术的高效性和准确性有助于对眼科肿瘤及遗传疾病相关差异表达基因的筛查。蛋白质组学有助于分析眼科疾病状态下眼内液体或细胞中基因表达高低所引起的蛋白表达谱及功能改变,从而揭示疾病的发生机制。本文主要综述生物信息学在眼科疾病的应用,并初步展望其对相关疾病治疗的影响、目前存在的问题及未来的发展趋势。

摘要： 桂北壮族传统聚落景观蕴含着独特的民族特色文化秩序和逻辑,是我国西南山地少数民族景观基因内在规律的外在空间表现.基于景观基因相关理论与方法,探寻桂北山地传统壮族村寨的文化特质,并对有遗传特性的景观基因符号进行识别、提取和分类,构建景观基因谱系,进而提出景观基因的转译传承策略.结果表明:(1)桂北山地壮族传统聚落景观基因细分为物质景观基因和非物质景观基因,具体可从选址布局、建筑技艺、景观环境、社会习俗和文化艺术5个类别进行归纳,根据其外化特征,构建景观基因谱系;(2)山地少数民族村寨景观基因可从基因提纯、基因解构、基因改良和基因重组等方面进行转译传承.从景观基因的视角对桂北壮寨景观内涵特征进行文字和图示化系统性总结,有助于为桂北山地地区传统壮族村寨保护体系的建立以及村寨未来的开发建设提供新思路.

摘要： [目的]根据传统聚落景观基因理论,构建大研古镇景观基因指标体系,并识别提取其景观基因特征,分析传统聚落的地域景观特质.旨在从文化地理学视角认识和保护传统聚落的景观基因,拓展景观基因理论的应用领域与内容体系,并为大研古镇的旅游开发和景观基因保护提供科学依据.[方法]以景观基因理论为指导,选取丽江大研古镇为研究对象,结合实地调研、历史文献资料查阅等研究方法,从物质形态基因与文化承载基因两方面构建大研古镇景观基因指标体系.综合运用景观基因的构成属性与提取方法,将大研古镇景观基因分为主体基因、附着基因、混合基因与变异基因,识别传统聚落的地域文化特质.[结果]大研古镇的物质形态基因可从环境特征、民居建筑、公共空间、官府衙署4个角度考量,文化承载基因可以从纳西文化、茶马文化、宗教信仰、曲艺舞蹈、节庆习俗5个角度考量.然后根据景观基因的构成属性识别提取结果为:东巴文化、纳西古乐、纳西民居凝聚了古镇的文化精髓,成为核心影响因素,是古镇的主体景观基因;木府、四方街、三眼井与桥市空间是依附于纳西文化而存在的附着基因,并对大研古镇的主体景观基因起到补充作用;背山面水的村落选址与顺水布街有机生长的空间格局是混合基因;富有纳西民族特色的"三朵节"是大研古镇的变异基因.[结论]少数民族传统聚落景观基因的形成及演变,是其权利机制与文化演变的体现.通过提取与识别大研古镇传统聚落的景观基因,可揭示与凝练地域文化的人文地理性和传统聚落的社会文化性.

摘要： 乡村景观基因是聚落特有的、可传承的因子,蕴含着自然地理、经济社会和历史文化等多种地域信息.对聚落景观基因的识别与梳理是传统村落保护与发展工作的前提.文章通过对青海河湟地区乡村景观特征的分析,结合景观基因理论,对该地区乡村景观基因进行识别,包含环境特征基因、布局特征基因、建筑特征基因及文化特征基因四方面;结合信息分类编码技术,构建乡村景观基因编码模型,形成青海河湟地区乡村景观基因信息库,为该地区地域性乡村景观营造提供系统的、数字化的指导信息和依据.

摘要： 通过分析村落遗产在旅游开发中存在的开发过度、对遗产基因认识缺失等主要问题,倡导村落遗产旅游开发应识别村落遗产基因,保证旅游开发中的原生性,防止村落遗产旅游开发中村落遗产的基因变异,从村落遗产社会功能、精神信仰、原生态保护等视角分析村落遗产的文化认同,提出村落遗产价值回归才是避免村镇地域"乡村性"消弭和乡村旅游持续发展的有效途径。

摘要： [目的]根据景观基因理论,构建昆明圆通寺景观基因指标体系,并识别提取景观基因特征,分析云南寺观园林的文化景观特质.旨在从文化地理学视角认识和保护云南寺观园林的景观基因,拓展景观基因理论的应用领域与内容体系,并为云南寺观园林的历史遗迹留存保护和旅游开发提供科学依据.[方法]以景观基因理论为指导,选取昆明圆通寺为研究对象,结合文献研究法、实地调研法、图解分析法等,从物质景观基因与文化特征基因两方面构建昆明圆通寺景观基因指标体系.综合运用景观基因的构成属性与提取方法,将圆通寺景观基因分为主体基因、附着基因、混合基因与变异基因,识别云南寺观园林的地域文化特质.[结果]昆明圆通寺的物质景观基因可从环境特征、景观布局、标志性建筑、水系景观空间形态、植物造景5个角度考量,文化特征基因可以从宗教文化、哲学思想、诗画意境3个角度考量.然后根据景观基因的构成属性识别提取结果为:圆通宝殿、八角亭主体建筑以及中轴对称的布局方式为圆通寺景观基因体系的主体基因.圆通胜境坊、天王殿、放生池、三孔石桥等景观元素在景观基因识别中对主体基因起辅助作用,归纳为附着基因.寺观选址、两系三传、铜佛殿等为混合基因.圆通寺在节假日举行的法事活动或宗教活动为变异基因.上述4种景观基因相辅相成,共同构建昆明圆通寺的景观基因体系.[结论]云南寺观园林的景观基因是"两系三传"佛教文化的渗透融合.通过提取与识别昆明圆通寺的景观基因,可凝练寺观园林地域文化的人文地理性和社会文化性.

摘要： 目的:应用ITS2序列鉴别禹州漏芦和漏芦药材的真伪,为临床准确用药提供可靠的基因识别方法.方法:收集多基原药材禹州漏芦基原物种蓝刺头和华东蓝刺头共14份样品和漏芦药材基原物种祁州漏芦8份样品,经实验获取ITS2序列,结合GenBank中20条相关近缘混伪品序列,建立以上物种和混伪品DNA条形码鉴定方法;将从市场上收集的11份禹州漏芦和20份漏芦药材的ITS2序列与以上序列进行比对分析和构建系统NJ树.结果:禹州漏芦两个基原物种的序列主导单倍型相同;禹州漏芦和漏芦药材基原物种最大K2P距离均小于其与混伪品的种间最小K2P距离;系统NJ树分析均能准确区分禹州漏芦和漏芦药材与各自混伪品.药材检测结果表明,11份禹州漏芦中10份为正品,1份为伪品;20份漏芦中2份为正品,18份为伪品.结论:本研究建立了基于ITS2序列的禹州漏芦和漏芦药材DNA条形码鉴定方法,可用于快速检测禹州漏芦和漏芦药材真伪.

摘要： 目的：采用ITS2序列鉴定从市场上收集的矮地茶药材,为保证矮地茶药用安全提供可靠的基因识别方法.rn 方法：收集矮地茶药材基原物种紫金牛及其混伪品共17个物种56份样品,并从NCBI下载6条相关序列,分析以上物种ITS2序列的种内和种间变异位点、Kimura 2-parameter(K2P)距离,并构建系统邻接(NJ)树,建立基于ITS2序列的矮地茶药材DNA条形码鉴定技术方法.同时,从市场上随机收集15份矮地茶药材样品,通过ITS2序列比对和构建系统NJ树判定药材真伪.rn 结果：紫金牛ITS2序列种内K2P距离最大值(0.0059)和平均值(0.0010)均明显小于其与混伪品种间K2P距离最小值(0.0364)和平均值(0.1159),系统NJ树能将紫金牛与混伪品明显区分开;15份矮地茶药材的序列比对和系统NJ树鉴定结果表明,其中13份为正品,2份为混伪品.rn 结论：本研究建立了基于ITS2序列的矮地茶药材DNA条形码鉴定技术方法,为快速检测市场流通的矮地茶药材真伪提供了可借鉴的基因识别方法.

摘要： 本文介绍了上下文相关的隐Markov模型的概念,并在此基础上提出了一种新的基于比较基因组的隐Markov模型,以用于非编码RNA基因的识别。

摘要： 本研究旨在采用计算机识别法发现具有自主知识产权和重要功能的人类新基因并经实验初步证实。采用的具体技术路线如下：rn 1)在公共数据库选择感兴趣的EST或cDNA；rn 2)全自动化运行SiClone软件进行EST装配；rn 3)在nr数据库通过比对筛选全新的cDNA contig；rn 4)所筛新cDNA contig的人工拼结和校对；rn 5)ORF及其侧翼区的分析；rn 6)编码蛋白结构与功能,特别是结构域和Motif的电子预测；rn 7)引物设计,RT-PCR实验和cDNA测序；rn 8)进一步实验确认与功能研究。rn 以PubMed公布基因芯片差显表达cDNA和GenBank EST数据库下载脾脏、淋巴结和胸腺表达cDNA以及在神威-IV超级计算机上拼接的6万余条ContigcDNA这3类cDNA为基础,均识别到人类新基因。计算机识别到的800余个编码小分子肽类人类新基因,具有典型基因特点和一定功能结构域,其中23个基因被GenBank接受并被国际人类基因组组织(HUGO)基因命名委员会批准使用了标准化的基因命名符号。首批选择16个人类新基因用RT-PCR实验和cDNA测序验证,结果均获得预期序列,其中半数基因是具有特定重要功能结构域的基因。特别是3个人类新基因(RABL3,ZNF362和C17orf32)的成功克隆及其小鼠和大鼠同源基因的克隆对促进新基因识别软件的开发可能具有重要的理论意义。所获新的人类细胞增殖与分化相关癌基因及转录因子基因RABL3,ZNF362～362,SPRYDl,C17orf32和C1orf31等的体内、外功能鉴定在实施中,意外发现,C3orf6基因定位于3号染色体NTl_005994.11的914449～916853位核苷酸,识别物mRNA长2405bp,经Nortlfern Blotting证实全长3000 bp多。rn 该基因ORF位于1742～2326bp,上游同一相位第6密码子为终止码TGA,并且前面还有多个终止码,下游有加尾信号AATAAA和PolyA尾。该基因ORF起始码上游1714 bp基因组DNA序列,在517～567,561～611和1229～1279区段有可能性分别为80％,97％和88％的3个启动子序列。在包含17或22氨基酸信号肽的194氨基酸残基核蛋白区段上有上皮细胞生长因子样结构域标签(EGF-1ike dolmainsignature),与浸润性B淋巴瘤基因(BAL：B aggressivelymphoma gene)紧密连锁。将C3orf6基因该区段(194氨基酸肽段)真核重组质粒注射入7～8周龄雄性Balb／c小鼠(体重约25克)后腿横纹肌后14 d,发现病理组织学观察具有明显的脾脏与淋巴结淋巴细胞反应性增生,主要是大量T淋 ,巴细胞,B淋巴细胞与巨噬细胞增生；在胸腺皮质,胸腺细胞增多；在肺支气管粘膜下,淋巴细胞和白细胞增多；在小肠粘膜下,襻氏小体分泌旺盛,分泌颗粒增多。29只7～8周龄雄性Balb／c小鼠(体重约25 g),只有3只注射含该区段C3orf6基因的真核重组质粒,20只注射可能使脾脏与淋巴结免疫细胞产生增生反应的其它基因真核重组质粒,6只阴性对照组Balb／c小鼠注射空载体质粒或生理盐水。结果发现,注射C3orf6基因真核重组质粒的3只小鼠全部出现强烈一致的脾脏与淋巴结免疫细胞增生反应,与阴性对照组小鼠相比显示了明显的差异；20只阳性对照小鼠出现程度不同的同类脾脏与淋巴结免疫细胞增生反应。由此提示C3orf6可能与细胞因子肿瘤免疫有关,说明该基因片段的预测功能与动物实验测定功能基本一致。斑马鱼体内实验研究结果证实,SPRYDl明显是与神经发育有关的细胞增殖与分化相关基因。细胞内反义技术实验研究结果表明,RABL3可能是有抑制凋亡作用的原癌基因。

摘要： 本文设计了一种新型菁染料MTC,通过其聚集状态的改变及单体荧光增强的程度,可以简单迅速的识别出双链DNA与G-四链体,以及各种不同结构的G-四链体。另外,通过扫描激光共聚焦显微镜,MTC对组装在Au表面的双链DNA和G-四链体也能很好的定位和识别。

摘要： 本文设计了一种新型菁染料MTC,通过其聚集状态的改变及单体荧光增强的程度,可以简单迅速的识别出双链DNA与G-四链体,以及各种不同结构的G-四链体。另外,通过扫描激光共聚焦显微镜,MTC对组装在Au表面的双链DNA和G-四链体也能很好的定位和识别。

摘要： 本文设计了一种新型菁染料MTC,通过其聚集状态的改变及单体荧光增强的程度,可以简单迅速的识别出双链DNA与G-四链体,以及各种不同结构的G-四链体。另外,通过扫描激光共聚焦显微镜,MTC对组装在Au表面的双链DNA和G-四链体也能很好的定位和识别。

摘要： 本文设计了一种新型菁染料MTC,通过其聚集状态的改变及单体荧光增强的程度,可以简单迅速的识别出双链DNA与G-四链体,以及各种不同结构的G-四链体。另外,通过扫描激光共聚焦显微镜,MTC对组装在Au表面的双链DNA和G-四链体也能很好的定位和识别。

摘要： 本文对金属螯合在提高电化学活性开关分子信标DNA识别热稳定性中的作用进行了阐述。分子信标是近年来发展起来的一类生物探针。分子信标之所以比线性探针拥有较高的特异性和选择性，是因为其茎部能垒的存在，因此，提高茎部热稳定性意味着提高其特异性和选择性。虽然改变茎部的序列和长度以及人工修饰茎部碱基骨架均可以达到提高茎部热稳定性的目的，但是这些策略成本较高且复杂。文章介绍了利用茎部末端标记物和金属离子形成鳌合物来提高电化学活性开关分子信标的茎部热稳定性，此策略简单且成本低廉。

摘要： 本申请涉及可以检测24种肺炎致病菌耐药基因的基因芯片。这24种肺炎致病菌耐药基因来自氨基糖苷类、喹诺酮类、超广谱β内酰胺酶类(ESBLs)、头孢菌素类(AmpC)、碳青霉烯类、耐万古霉素、耐甲氧西林和导致膜通透性改变的基因，与临床关系最为密切。该基因芯片是通过反复设计和筛选，最终将灵敏度好，特异度高的探针固定在芯片上，不需要进行临床培养和药敏试验，操作简单快捷，在很大程度上为抗生素的合理使用争取了宝贵的时间，值得临床推广应用。

摘要： 本发明涉及生物工程领域，具体公开了SEQ ID No：1所示的信号识别粒子亚基和/或编码该信号识别粒子亚基的核苷酸序列在制备耐酸性双歧杆菌中的应用，还公开了含有如上所述的核苷酸序列的重组表达质粒以及含有如上所述的信号识别粒子亚基和/或编码该信号识别粒子亚基的核苷酸序列和/或所述重组表达质粒的耐酸性双歧杆菌。通过上述技术方案，将编码SEQ ID No：1所示的信号识别粒子亚基的基因，优选为含有该基因的质粒P18P转化到双歧杆菌，优选为双歧杆菌CGMCCNo.2265中，能够耐受pH低至1、优选低至2、更优选低至3.5的酸度。

摘要： 本发明提供了一对特异识别IκBα基因的多肽及其编码基因和应用。上述多肽对由多肽甲和多肽乙组成；所述多肽甲由18个TAL核酸识别单元组成，每个TAL核酸识别单元中具有两个双连氨基酸；所述多肽乙由18个TAL核酸识别单元组成，每个TAL核酸识别单元中具有两个双连氨基酸；所述多肽甲如序列表的序列2所示；所述多肽乙如序列表的序列4所示。本发明提供的多肽对可以特异识别IκBα基因，通过在猪上对IκBα基因进行敲除或改造对研究猪的延缓性排斥反应有着重要的意义。

摘要： 本发明公开了一对特异识别绵羊HSP70.1基因的多肽及其编码基因和应用，该多肽对由多肽甲和多肽乙组成；多肽甲由16个TAL核酸识别单元组成，每个TAL核酸识别单元中具有两个双连氨基酸；多肽乙由16个TAL核酸识别单元组成，每个TAL核酸识别单元中具有两个双连氨基酸。本发明可实现在细胞或个体水平上对绵羊HSP70.1基因进行敲除或修饰，以解析绵羊HSP70.1基因的功能、构建绵羊HSP70.1基因突变库或获得相关疾病模型，为绵羊育种及医药研发服务。

摘要： 本发明公开了一种识别基因编辑动物全基因组变异的方法。通过分析供体细胞和基因编辑后新生克隆猪的全基因组，使用mutect2、strelka2和/或lofreq分析识别基因编辑造成的全基因组范围内的变异位点。本发明的分析方法用以分析全基因组范围内的所有突变，不以sgRNA同源性预测作为依据，能最大限度地检测所有存在的变异位点；以无偏的方式直接分析基因编辑猪与供体细胞的基因差异，不受遗传学影响，且操作方便，高效处理批量样品；适用于所有克隆动物全基因组比较分析，适用于任何工具和方法对供体细胞造成变异的检测，包括克隆操作自身对克隆动物造成变异的检测。

摘要： 本发明公开一种基于稀疏性因子分析的基因‑基因交互作用识别方法(Sparse Factor Analysis for Epistasis,EPISFA)，其中包含以下步骤。1)输入基因型原始数据，并根据基因之间的连锁不平衡系数进行筛选；2)数据随机分块3)将数据按患病状态分为患病和非患病人群，分别计算两组的相关系数矩阵，利用Fisher变换扣除两人群的相关系数矩阵基因位点相关性；4)使用稀疏性因子分析方法学习模型权重；5)交叉验证，选择模型参数并识别相应的基因‑基因交互作用。试验表明此方法的统计功效和计算效率均较高，具有良好应用前景。

摘要： 本发明提供了一种识别猪ROSA26基因的sgRNA及其编码DNA、基因编辑方法、试剂盒和应用，涉及基因工程技术领域。该特异性识别猪ROSA26基因的sgRNA识别猪ROSA26基因的第一内含子，且用于CRISPR/Cpf1系统，含有如SEQ ID NO.1所示的负责识别靶片段的序列。该sgRNA配合CRISPR/Cpf1系统，敲除效率为27％且特异性强，在进行序列敲除时，能有效减少脱靶现象，减少非特异性切割对基因组带来的不利影响。

摘要： 本实用新型公开了一种具有连续识别基因信息功能的基因检测仪，属于基因检测技术领域，包括底座和外壳，所述外壳顶部设有检测口，所述外壳内设有可相对转动的检测支座，所述外壳上设有驱动电机，所述检测支座的上下两端均设有检测座，所述检测座上设有V形的检测凹面，所述检测凹面上设有若干基因探针，还包括用于清洗检测凹面的清洗结构，所述外壳上设有显示屏和控制器，所述驱动电机、基因探针、显示屏均与控制器电连接。针对现有的具有连续识别基因信息功能的基因检测仪检测效率低下的技术问题，本实用新型提供了一种具有连续识别基因信息功能的基因检测仪，它可以使基因检测的效率得到了极大的提升，舍去了两次基因检测之间的清洗时间。

摘要： 本发明涉及一种基于PLS多扰动集成基因选择的肿瘤特异基因识别方法，针对肿瘤微阵列数据的特点，引入不同的扰动机制，给出多扰动集成的基因选择的分析框架；利用PLS多基因度量方法，在该框架下发展出新的基于PLS集成基因选择方法。一方面，本发明的方法是基于子集的整体效应，能够快速识别出具有差异表达的基因，同时还能识别出差异表达信号微弱的基因；另一方面，本发明的方法是基于多重扰动机制，能够识别出一系列不同的，长度小且判别能力强的基因子集。因此，本发明的方法能够识别出的一系列不同的基因子集和弱差异表达基因，通过它们能够更加全面的认识肿瘤基因的特异表达模式。

摘要： 本申请提供了一种识别合子型基因激活ZGA基因的方法及装置，其中，所述方法包括：获取胚胎发育过程中细胞基因的基因表达矩阵，其中，基因表达矩阵包括处于不同发育时间点的细胞基因的表达量；对不同发育时间点进行划分，得到胚胎的不同发育阶段；基于得到的不同发育阶段将基因表达矩阵划分为N个基因表达子矩阵，其中，每个基因表达子矩阵包括处于相同发育阶段的细胞基因的表达量；获取与每个基因表达子矩阵对应的表达量特征值；基于各个基因表达子矩阵和获得的表达量特征值确定ZGA基因。这样一来，通过从细胞基因中确定出的各个基因表达子矩阵和获得的表达量特征值确定ZGA基因，误差较小，可靠性较高，从而提高了细胞基因识别的准确率。