获得性免疫缺陷综合征患者的新生隐球菌基因多态性研究

摘要

本文旨在调查2003年1月―2007年12月分离自上海地区获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者的新生隐球菌临床株的配型及基因型分布特征,为隐球菌病的诊疗提供科学依据.首先以M13为单引物对模板DNA进行聚合酶链反应(PCR)扩增,参照标准株指纹图将临床株鉴定至基因型;同时对12株来自AIDS患者的新生隐球菌临床株的内转录间隔区(ITS)基因进行PCR扩增、序列分析,以CLUSTAL W1.83软件多重比对分析ITS序列的差别,MEGA3.1软件处理数据,NJ法绘制系统进化树,Bootstrapping法对系统进化树结果进行统计学检验,区分新生隐球菌格鲁比变种、新生变种及格特变种菌株;最后选用特异性引物PCR特异性扩增相关基因,鉴定α和a配型. 结果显示,分离自上海地区的12株隐球菌临床株中,9株(75%)为VNⅠ基因型/α配型菌株,3株(25%)为VNⅡ基因型/α配型菌株,且ITS基因序列分析可将各临床株鉴定至变种水平.本研究提示,分离自上海地区AIDS患者的新生隐球菌临床株存在一定的遗传多态性,以VNⅠ基因型/α配型菌株为主,有少量VNⅡ基因型/α配型菌株.