矩阵填充结合相似性约束的抗癌药物敏感性预测

摘要

为了进行抗癌药物敏感性预测,提出了一种基于矩阵填充与相似性约束的抗癌药物敏感性预测模型——MS模型。该模型综合利用细胞系基因表达数据以及药物化学结构信息,并结合药物与细胞系之间的相似性信息,对抗癌药物敏感性进行预测。将模型应用于CCLE和GDSC这两个基准数据集,十倍交叉验证结果显示:MS模型的预测性能优于部分已发表的经典模型。