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2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics

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1.Variability assessment of LC-MS experiments and its application to experimental design and difference detection

机译：LC-MS实验的变异性评估及其在实验设计和差异检测中的应用
- 作者：Zhao Yi;Tsai Tsung-Heng;Di Poto Cristina;Pannell Lewis K.;Tadesse Mahlet G.;Ressom Habtom W.
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
2.Robust MS serum sample classification in proteomics by the use of inverse problems

机译：通过使用反问题对蛋白质组学进行可靠的MS血清样品分类
- 作者：Szacherski P.;Giovannelli J.-F.;Gerfault L.;Giremus A.;Grangeat P.
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Bayesian statistics;
- SRM;
- classification inverse problems;
- hierarchical forward model;
- mass spectrometry;
- proteomics;
3.External control of probabilistic boolean networks using inhomogeneous Markov chains

机译：使用非齐次马尔可夫链的概率布尔网络的外部控制
- 作者：Josserand Timothy M.
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Markov chain;
- control;
- probabilistic Boolean network;
4.Inference of time-varying gene networks using constrained and smoothed Kalman filtering

机译：使用约束和平滑卡尔曼滤波推断时变基因网络
- 作者：Rasool Ghulam;Bouaynaya Nidhal
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
5.Determining gene function in boolean networks using boolean satisfiability

机译：使用布尔可满足性确定布尔网络中的基因功能
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
6.Integration of multiple data sources for identifying functional modules using Bayesian network

机译：集成多个数据源以使用贝叶斯网络识别功能模块
- 作者：Wang Jinlian;Yuan Hongyan;Tadesse Mahlet G.;Ressom Habtom W
- 会议名称：《》 | 2012年
- Bayesian network;
- data integration;
- hepatocellular carcinoma;
- systems biology;
7.Inferring gene functions from metabolic reactions

机译：从代谢反应推断基因功能
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
8.Hierarchical Bayesian methods for integration of various types of genomics data

机译：集成各种基因组数据的分层贝叶斯方法
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Bayesian modeling;
- genomics;
- integrative analysis;
- shrinkage priors;
9.Anticancer drug sensitivity analysis: An integrated approach applied to Erlotinib sensitivity prediction in the CCLE database

机译：抗癌药物敏感性分析：一种集成方法，用于CCLE数据库中的厄洛替尼敏感性预测
- 作者：Pal Ranadip;Berlow Noah;Haider Saad
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
10.Cell type specific analysis of human transcriptome data

机译：人类转录组数据的细胞类型特异性分析
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
11.Utilizing RNA-Seq data for cancer network inference

机译：利用RNA-Seq数据进行癌症网络推断
- 作者：Cai Ying;Fendler Bernard;Atwal Gurinder S.
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- RNA-Seq;
- cancer;
- graphical lasso;
- maximum entropy;
12.A message passing algorithm for reference-guided sequence assembly from high-throughput sequencing data

机译：用于高通量测序数据的参考引导序列组装的消息传递算法
- 作者：Shen Xiaohu;Vikalo Haris
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- SNP detection;
- high-throughput DNA sequencing;
- message passing;
13.Fast DNA barcode generating algorithm using Radix Coding method

机译：使用Radix编码方法的快速DNA条形码生成算法
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
14.Design of short barcodes for next generation sequencing of DNA and RNA

机译：短条形码的设计，用于DNA和RNA的下一代测序
- 作者：Schober Steffen;Mir Katharina;Neuhaus Klaus;Bossert Martin
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
15.NMF based approach for finding recurrent aberrations in DNA copy number data

机译：基于NMF的方法来查找DNA拷贝数数据中的重复像差
- 作者：Elhenawy Mohammed;Yu Guoqiang
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- DNA copy number abberations;
- non-negative matrix factorization;
- recurrent abberations;
16.MiB: A comparative assembly processing pipeline

机译：MiB：比较的装配处理流程
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Bayesian Estimation;
- Genome Assembly;
- Minimum Description Length;
- de-Bruijn Graphs;
17.Accurate identification of significant aberrations in contaminated cancer genome

机译：准确鉴定受污染的癌症基因组中的重大像差
- 作者：Hou Xuchu;Yu Guoqiang;Yuan Xiguo;Zhang Bai;Shih Ie-Ming;Zhang Zhen;Clarke Robert;Madhavan Subha
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- copy number alterations;
- normal tissue contamination;
- significant copy number aberrations;
18.A comparison of periodicity profile methods for sequence analysis

机译：序列分析的周期性分析方法的比较
- 作者：Bellani Manas;Epps Julien;Huttley Gavin A.
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- period estimation;
- periodicity profile;
- sequence analysis;
19.Feature ranking based on synergy networks to identify prognostic markers in DPT-1

机译：基于协同网络的特征排名以识别DPT-1中的预后标记
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Immunologic markers;
- Metabolic markers;
- Spectral methods;
- Synergy;
- Type-1 Diabetes;
20.A Bayesian model for SNP discovery based on next-generation sequencing data

机译：基于下一代测序数据的贝叶斯SNP发现模型
- 作者：Xu Yanxun;Zheng Xiaofeng;Yuan Yuan;Estecio Marcos R;Issa Jean-Pierre;Ji Yuan;Liang Shoudan
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
21.Information theoretic feature selection for high dimensional metagenomic data

机译：高维元数据的信息理论特征选择
- 作者：Ditzler Gregory;Rosen Gail;Polikar Robi
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
22.A Bayesian graphical model for integrative analysis of TCGA data

机译：用于TCGA数据综合分析的贝叶斯图形模型
- 作者：Xu Yanxun;Zhang Jie;Yuan Yuan;Mitra Riten;Muller Peter;Ji Yuan
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
23.Identification of functional genomic regions with copy number alteration in liver cancer

机译：肝癌中具有拷贝数改变的功能基因组区域的鉴定
- 作者：Hsiao Tzu-Hung;Chen Hung-I Harry;Chen Yidong
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Keyswords: Copy number alteration;
- gene set enrichment;
- liver cancer;
- pathway analysis;
24.A non-parametric approach for estimating stromal contamination in cancer samples

机译：用于估计癌症样品中基质污染的非参数方法
- 作者：Elhenawy Mohammed;Hou Xuchu;Yu Guoqiang
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- DNA copy number change;
- matched pair permutation test;
- normal tissue contamination;
- tissue heterogeneity;
25.Latent feature decompositions for integrative analysis of diverse high-throughput genomic data

机译：潜在特征分解，可对各种高通量基因组数据进行综合分析
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
26.Logistic principal component analysis for rare variants in gene-environment interaction analysis

机译：基因-环境相互作用分析中稀有变体的逻辑主成分分析
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
27.An evaluation for merging signaling pathways by using protein-protein interaction data

机译：通过使用蛋白质-蛋白质相互作用数据评估信号传导途径的合并
- 作者：Wu Xiaogang;Chen Jake Y.
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Signaling pathways;
- pathway merging;
- protein-protein interactions;
- quantitative evaluation;
28.Sparse Bayesian graphical models for RPPA time course data

机译：RPPA时程数据的稀疏贝叶斯图形模型
- 作者：Mitra Riten;Mueller Peter;Ji Yuan;Mills Gordon;Lu Yiling
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
29.Optimal therapeutic methods with random-length response in probabilistic boolean networks

机译：概率布尔网络中具有随机长度响应的最佳治疗方法
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
30.Genome-wide meta-regression of gene-environment interaction

机译：基因组环境与基因相互作用的全基因组回归
- 作者：Xu Xiaoxiao;Shi Gang;Nehorai Arye
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
31.A comparative study of methods for detecting small somatic variants in disease-normal paired next generation sequencing data

机译：在疾病正常配对下一代测序数据中检测小体细胞变异的方法的比较研究
- 作者：Wang Qingguo;Zhao Zhongming
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- computational tool;
- deletion;
- insertion;
- next generation sequencing;
- single-nucleotide polymorphism;
- variant call;
32.OBGene: Optimal barcode generator for NGS experiments

机译：OBGene：用于NGS实验的最佳条形码生成器
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
33.Detection of short exons in DNA sequences using complex wavelet transform of structural features

机译：使用结构特征的复杂小波变换检测DNA序列中的短外显子
- 作者：Provaznik Ivo;Kubicova Vladimira;Skutkova Helena;Nedved Jiri;Tkacz Ewarvst;Babula Petr;Kizek Rene
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- DNA sequence analysis;
- DNA structure;
- Exon detection;
- wavelet analysis;
34.Multiclass cancer-microarray classification algorithm with pair-against-all redundancy

机译：具有双对全冗余的多类癌症-微阵列分类算法
- 作者：Bosio Mattia;Bellot Pau;Salembier Philippe;Oliveras-Verges Albert
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- ECOC;
- Microarray;
- classification;
- multiclass;
35.Comprehensive analyses of tumor suppressor genes in protein-protein interaction networks: A topological perspective

机译：蛋白质-蛋白质相互作用网络中肿瘤抑制基因的综合分析：拓扑学观点
- 作者：Zhao Min;Sun Jingchun;Zhao Zhongming
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Global network characteristics;
- Network topology;
- Protein-protein interaction;
- Tumor suppressor gene;
36.Network-based methods to identify highly discriminating subsets of biomarkers

机译：基于网络的方法来识别生物标志物的高度区分性子集
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Column Generation;
- Discriminating Biomarkers;
- Maximum Weighted Multiple Clique Problem;
37.A new algorithm for predicting competing endogenous rnas

机译：一种预测竞争性内源鼻的新算法
- 作者：Flores Mario;Huang Yufei
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- ceRNAs;
- microRNA target prediction;
- microRNAs;
38.An SILAC quantification algorithm for LC-FTMS

机译：LC-FTMS的SILAC定量算法
- 作者：Cui Jian;Ma Xuepo;Zhang XiaoLin;Haskins William;(Michelle) Zhang Jiangiu
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
39.Normalization of LC-MS data using Gaussian process

机译：使用高斯过程归一化LC-MS数据
- 作者：Nezami Ranjbar Mohammad R.;Tadesse Mahlet G.;Wang Yue;Ressom Habtom W.
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
40.Toward exhaustive gating of flow cytometry data

机译：走向详尽的流式细胞术数据门控
- 作者：Qiu Peng
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
41.Optimal Bayesian classification and its application to gene regulatory networks

机译：最优贝叶斯分类及其在基因调控网络中的应用
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
42.Inferring weighted and directed gene interaction networks from gene expression data using the phi-mixing coefficient

机译：使用phi混合系数从基因表达数据推断加权和定向基因相互作用网络
- 作者：Singh Nitin;Ahsen Mehmet Eren;Mankala Shiva;Vidyasagar M.;White Michael
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
43.Integration of imaging and systems biology to study treatment of medulloblastoma

机译：影像学和系统生物学的结合研究髓母细胞瘤的治疗
- 作者：Wang Sean S.;Rodriguez Olga C.;Tian Ye;Ye Shaozhen;Petricoin Emanual;Albanese Chris
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Cancer imaging;
- Molecular analysis;
- Network analysis;
- Survival analysis;
44.Integrative analysis of methylation and gene expression data in TCGA

机译：TCGA中甲基化和基因表达数据的综合分析
- 作者：Liu Yihua;Qiu Peng
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
45.Detection and clustering of palindrome in genome sequences by DCT-II method

机译：DCT-II法检测基因组序列回文序列
- 作者：Rizvi Ahsan Z.;Bhattacharya C.
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Clustering;
- DCT-II;
- Palindrome;
46.Finding robust pathway markers for cancer classification

机译：寻找用于癌症分类的可靠途径标记
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
47.A statistical test for intrinsically multivariate predictive genes

机译：内在多元预测基因的统计检验
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
48.A new phenotypically constrained control policy in boolean networks based on basins of attraction

机译：基于吸引域的布尔网络中一种新的表型约束控制策略
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Boolean network;
- Genetic regulatory network;
- basins of attraction;
- network intervention;
- probabilistic Boolean network;
49.Combination therapy design for targeted therapeutics from a drug-protein interaction perspective

机译：从药物-蛋白质相互作用的角度看靶向治疗的联合治疗设计
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
50.Integrating multi-platform genomic data using hierarchical Bayesian relevance vector machines

机译：使用分层贝叶斯相关向量机集成多平台基因组数据
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Bayesian modeling;
- genomics;
- high-dimensional data analysis;
- multiple kernel learning;
- prediction;
51.Improving the flexibility of RNA-Seq data analysis pipelines

机译：提高RNA-Seq数据分析流程的灵活性
- 作者：Phan John H.;Wu Po-Yen;Wang May D.
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- Next-generation sequencing;
- RNA-seq;
- data analysis pipeline;
- gene expression;
- spliced mapping;
52.Determining the relative prevalence of different subpopulations in heterogeneous cancer tissue

机译：确定异质癌组织中不同亚群的相对患病率
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- chemotherapy (key words);
- heterogeneous tumor;
- subpopulation modelling;
53.An investigation of clinical outcome prediction from integrative genomic profiles in ovarian cancer

机译：综合卵巢癌基因组学资料预测临床结局的研究
- 作者：Zhang Lin;Liu Hui;Hsiao Tzu-Hung;Chen Yidong;Huang Yufei
- 会议名称：《2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics》 | 2012年
- clinical outcome prediction;
- data integration;
- elastic net;
- ovarian cancer;