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中文名称：BMC生物信息学

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1.ncRNAclassifier: a tool for detection and classification of transposable element sequences in RNA hairpins

机译：ncRNAclassifier：检测和分类RNA发夹中转座因子序列的工具
- 作者：Sébastien Tempel;Nicolas Pollet;Fariza Tahi
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
2.Prediction of DNA-binding propensity of proteins by the ball-histogram method using automatic template search

机译：球直方图法使用自动模板搜索预测蛋白质的DNA结合倾向
- 作者：Andrea Szabóová;Ond?ej Ku?elka;Filip ?elezny;Jakub Tolar
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第10期
3.Structural features based genome-wide characterization and prediction of nucleosome organization

机译：基于结构特征的全基因组表征和核小体组织的预测
- 作者：Yanglan Gan;Jihong Guan;Shuigeng Zhou;Weixiong Zhang
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
4.Ranked retrieval of segmented nuclei for objective assessment of cancer gene repositioning

机译：分段核的分级检索以客观评估癌症基因的位置
- 作者：William J Cukierski;Kaustav Nandy;Prabhakar Gudla;Karen J Meaburn;Tom Misteli;David J Foran;Stephen J Lockett
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
5.PupDB: a database of pupylated proteins

机译：PupDB：磺酰化蛋白的数据库
- 作者：Chun-Wei Tung
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
6.Generalization of the normal-exponential model: exploration of a more accurate parametrisation for the signal distribution on Illumina BeadArrays

机译：正指数模型的一般化：探索用于Illumina BeadArrays上信号分布的更精确的参数化
- 作者：Sandra Plancade;Yves Rozenholc;Eiliv Lund
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
7.Investigating drug repositioning opportunities in FDA drug labels through topic modeling

机译：通过主题建模研究FDA药品标签中的药物重新定位机会
- 作者：Halil Bisgin;Zhichao Liu;Reagan Kelly;Hong Fang;Xiaowei Xu;Weida Tong
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第15期
8.Quality assessment of protein model-structures based on structural and functional similarities

机译：基于结构和功能相似性的蛋白质模型结构的质量评估
- 作者：Bogumil M Konopka;Jean-Christophe Nebel;Malgorzata Kotulska
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
9.Exact biclustering algorithm for the analysis of large gene expression data sets

机译：精确的双聚类算法，用于分析大型基因表达数据集
- 作者：Oliver Voggenreiter;Stefan Bleuler;Wilhelm Gruissem
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第18期
10.An integrative variant analysis suite for whole exome next-generation sequencing data

机译：用于完整外显子组下一代测序数据的集成变体分析套件
- 作者：Danny Challis;Jin Yu;Uday S Evani;Andrew R Jackson;Sameer Paithankar;Cristian Coarfa;Aleksandar Milosavljevic;Richard A Gibbs;Fuli Yu
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
11.A novel k-mer mixture logistic regression for methylation susceptibility modeling of CpG dinucleotides in human gene promoters

机译：用于人类基因启动子中CpG二核苷酸甲基化敏感性建模的新型k-mer混合物logistic回归
- 作者：Youngik Yang;Kenneth Nephew;Sun Kim
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第3期
12.Bayesian probabilistic network modeling from multiple independent replicates

机译：来自多个独立副本的贝叶斯概率网络建模
- 作者：Kristopher L Patton;David J John;James L Norris
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第9期
13.Frnakenstein: multiple target inverse RNA folding

机译：科学怪人：多目标逆RNA折叠
- 作者：Rune B Lyngs?;James WJ Anderson;Elena Sizikova;Amarendra Badugu;Tomas Hyland;Jotun Hein
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
14.IBDsite: a Galaxy-interacting, integrative database for supporting inflammatory bowel disease high throughput data analysis

机译：IBDsite：一个与银河互动的集成数据库，用于支持炎症性肠病高通量数据分析
- 作者：I Merelli;F Viti;L Milanesi
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第14期
15.Stable stem enabled Shannon entropies distinguish non-coding RNAs from random backgrounds

机译：稳定的茎使能Shannon熵将非编码RNA与随机背景区分开
- 作者：Yingfeng Wang;Amir Manzour;Pooya Shareghi;Timothy I Shaw;Ying-Wai Li;Russell L Malmberg;Liming Cai
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第5期
16.Integrative prescreening in analysis of multiple cancer genomic studies

机译：综合预筛分析多种癌症基因组研究
- 作者：Rui Song;Jian Huang;Shuangge Ma
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
17.Predicting folding pathways between RNA conformational structures guided by RNA stacks

机译：预测由RNA堆栈指导的RNA构象结构之间的折叠途径
- 作者：Yuan Li;Shaojie Zhang
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第3期
18.CerealsDB 2.0: an integrated resource for plant breeders and scientists

机译：CerealsDB 2.0：植物育种家和科学家的综合资源
- 作者：Paul A Wilkinson;Mark O Winfield;Gary LA Barker;Alexandra M Allen;Amanda Burridge;Jane A Coghill;Keith J Edwards
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
19.Minimalist ensemble algorithms for genome-wide protein localization prediction

机译：用于全基因组蛋白定位预测的极简合奏算法
- 作者：Jhih-Rong Lin;Ananda M Mondal;Rong Liu;Jianjun Hu
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
20.Accuracy of RNA-Seq and its dependence on sequencing depth

机译：RNA-Seq的准确性及其对测序深度的依赖性
- 作者：Guoshuai Cai;Hua Li;Yue Lu;Xuelin Huang;Juhee Lee;Peter Müller;Yuan Ji;Shoudan Liang
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第13期
21.A systematic comparison of genome-scale clustering algorithms

机译：基因组规模聚类算法的系统比较
- 作者：Jeremy J Jay;John D Eblen;Yun Zhang;Mikael Benson;Andy D Perkins;Arnold M Saxton;Brynn H Voy;Elissa J Chesler;Michael A Langston
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第10期
22.Computational approaches to protein inference in shotgun proteomics

机译：shot弹枪蛋白质组学中蛋白质推断的计算方法
- 作者：Yong Fuga Li;Predrag Radivojac
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第16期
23.Compareads: comparing huge metagenomic experiments

机译：Compareads：比较大型宏基因组学实验
- 作者：Nicolas Maillet;Claire Lemaitre;Rayan Chikhi;Dominique Lavenier;Pierre Peterlongo
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第19期
24.Fold change and p-value cutoffs significantly alter microarray interpretations

机译：倍数变化和p值临界值会大大改变微阵列的解释
- 作者：Mark R Dalman;Anthony Deeter;Gayathri Nimishakavi;Zhong-Hui Duan
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第2期
25.miREvo: an integrative microRNA evolutionary analysis platform for next-generation sequencing experiments

机译：miREvo：用于下一代测序实验的整合式microRNA进化分析平台
- 作者：Ming Wen;Yang Shen;Suhua Shi;Tian Tang
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
26.Quantitatively integrating molecular structure and bioactivity profile evidence into drug-target relationship analysis

机译：定量整合分子结构和生物活性谱证据到药物-靶标关系分析中
- 作者：Tianlei Xu;Ruixin Zhu;Qi Liu;Zhiwei Cao
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
27.Accurate multiple sequence alignment of transmembrane proteins with PSI-Coffee

机译：跨膜蛋白与PSI-Coffee的精确多序列比对
- 作者：Jia-Ming Chang;Paolo Di Tommaso;Jean-Fran?ois Taly;Cedric Notredame
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第4期
28.Predicting tissue specific cis-regulatory modules in the human genome using pairs of co-occurring motifs

机译：使用共生基序对预测人类基因组中的组织特异性顺式调控模块
- 作者：Hani Z Girgis;Ivan Ovcharenko
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
29.Inference of reticulate evolutionary histories by maximum likelihood: the performance of information criteria

机译：通过最大可能性推论网状进化史：信息标准的执行
- 作者：Hyun Jung Park;Luay Nakhleh
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第19期
30.Personalized cloud-based bioinformatics services for research and education: use cases and the elasticHPC package

机译：个性化的基于云的生物信息学研究和教育服务：用例和elasticHPC软件包
- 作者：Mohamed El-Kalioby;Mohamed Abouelhoda;Jan Krüger;Robert Giegerich;Alexander Sczyrba;Dennis P Wall;Peter Tonellato
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第17期
31.Exploring biological interaction networks with tailored weighted quasi-bicliques

机译：使用量身定制的拟双斜体探索生物相互作用网络
- 作者：Wen-Chieh Chang;Sudheer Vakati;Roland Krause;Oliver Eulenstein
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第10期
32.RNAmap2D – calculation, visualization and analysis of contact and distance maps for RNA and protein-RNA complex structures

机译：RNAmap2D – RNA和蛋白质-RNA复杂结构的接触图和距离图的计算，可视化和分析
- 作者：Michal J Pietal;Natalia Szostak;Kristian M Rother;Janusz M Bujnicki
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
33.Mathematical modeling of the immune system recognition to mammary carcinoma antigen

机译：免疫系统识别乳腺癌抗原的数学模型
- 作者：Carlo Bianca;Ferdinando Chiacchio;Francesco Pappalardo;Marzio Pennisi
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第17期
34.TAPDANCE: An automated tool to identify and annotate transposon insertion CISs and associations between CISs from next generation sequence data

机译：TAPDANCE：一种自动工具，可从下一代序列数据中识别和注释转座子插入CIS以及CIS之间的关联
- 作者：Aaron L Sarver;Jesse Erdman;Tim Starr;David A Largaespada;Kevin A T Silverstein
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
35.MCMC-ODPR: Primer design optimization using Markov Chain Monte Carlo sampling

机译：MCMC-ODPR：使用马尔可夫链蒙特卡洛采样的引物设计优化
- 作者：James L Kitchen;Jonathan D Moore;Sarah A Palmer;Robin G Allaby
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
36.T3DB: an integrated database for bacterial type III secretion system

机译：T3DB：细菌III型分泌系统的综合数据库
- 作者：Yejun Wang;He Huang;Ming’an Sun;Qing Zhang;Dianjing Guo
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第1期
37.Linearization of ancestral multichromosomal genomes

机译：祖先多染色体基因组的线性化
- 作者：Ján Maňuch;Murray Patterson;Roland Wittler;Cedric Chauve;Eric Tannier
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第19期
38.Matching phosphorylation response patterns of antigen-receptor-stimulated T cells via flow cytometry

机译：通过流式细胞术匹配抗原受体刺激的T细胞的磷酸化反应模式
- 作者：Ariful Azad;Saumyadipta Pyne;Alex Pothen
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第2期
39.Introduction: advanced intelligent computing theories and their applications in bioinformatics

机译：简介：先进的智能计算理论及其在生物信息学中的应用
- 作者：M Michael Gromiha;De-Shuang Huang
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2012年第7期
40.Age-adjusted nonparametric detection of differential DNA methylation with case–control designs

机译：病例对照设计，年龄校正后的差异DNA甲基化非参数检测
- 作者：Hanwen Huang;Zhongxue Chen;Xudong Huang
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
41.FPD2GB2: Automating a transition from a customized genome browser to GBrowse2

机译：FPD2GB2：自动完成从自定义基因组浏览器到GBrowse2的转换
- 作者：Roger Chui;Jerzy W Jaromczyk;Neil Moore;Christopher L Schardl
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第17期
42.Modeling the next generation sequencing sample processing pipeline for the purposes of classification

机译：为分类目的建模下一代测序样品处理管道
- 作者：Noushin Ghaffari;Mohammadmahdi R Yousefi;Charles D Johnson;Ivan Ivanov;Edward R Dougherty
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
43.A survey of protein interaction data and multigenic inherited disorders

机译：蛋白质相互作用数据和多基因遗传性疾病调查
- 作者：Antonio Mora;Katerina Michalickova;Ian M Donaldson
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
44.A gene signature based method for identifying subtypes and subtype-specific drivers in cancer with an application to medulloblastoma

机译：基于基因特征的癌症亚型和亚型特异性驱动子鉴定方法及其在髓母细胞瘤中的应用
- 作者：Peikai Chen;Yubo Fan;Tsz-kwong Man;YS Hung;Ching C Lau;Stephen TC Wong
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第18期
45.Dinosolve: a protein disulfide bonding prediction server using context-based features to enhance prediction accuracy

机译：Dinosolve：蛋白质二硫键预测服务器，使用基于上下文的功能来增强预测准确性
- 作者：Ashraf Yaseen;Yaohang Li
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第13期
46.SNPranker 2.0: a gene-centric data mining tool for diseases associated SNP prioritization in GWAS

机译：SNPranker 2.0：一种以基因为中心的数据挖掘工具，用于GWAS中与疾病相关的SNP优先级排序
- 作者：Ivan Merelli;Andrea Calabria;Paolo Cozzi;Federica Viti;Ettore Mosca;Luciano Milanesi
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
47.Variational attenuation correction in two-view confocal microscopy

机译：两视图共聚焦显微镜的变分衰减校正
- 作者：Thorsten Schmidt;Jasmin Dürr;Margret Keuper;Thomas Blein;Klaus Palme;Olaf Ronneberger
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
48.An automated graphics tool for comparative genomics: the Coulson plot generator

机译：用于比较基因组学的自动化图形工具：Coulson图生成器
- 作者：Helen I Field;Richard MR Coulson;Mark C Field
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
49.A decision theory paradigm for evaluating identifier mapping and filtering methods using data integration

机译：使用数据集成评估标识符映射和过滤方法的决策理论范式
- 作者：Roger S Day;Kevin K McDade
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
50.bioWeb3D: an online webGL 3D data visualisation tool

机译：bioWeb3D：在线webGL 3D数据可视化工具
- 作者：Jean-Baptiste Pettit;John C Marioni
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
51.BioCause: Annotating and analysing causality in the biomedical domain

机译：BioCause：注释和分析生物医学领域的因果关系
- 作者：Claudiu Mih?il?;Tomoko Ohta;Sampo Pyysalo;Sophia Ananiadou
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
52.Finishing bacterial genome assemblies with Mix

机译：用Mix完成细菌基因组装配
- 作者：Hayssam Soueidan;Florence Maurier;Alexis Groppi;Pascal Sirand-Pugnet;Florence Tardy;Christine Citti;Virginie Dupuy;Macha Nikolski
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第15期
53.MosaicIA: an ImageJ/Fiji plugin for spatial pattern and interaction analysis

机译：MosaicIA：用于空间模式和交互分析的ImageJ / Fiji插件
- 作者：Arun Shivanandan;Aleksandra Radenovic;Ivo F Sbalzarini
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
54.A method to identify differential expression profiles of time-course gene data with Fourier transformation

机译：傅立叶变换识别时程基因数据差异表达谱的方法
- 作者：Jaehee Kim;Robert T Ogden;Haseong Kim
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
55.Molecular docking analysis of 2009-H1N1 and 2004-H5N1 influenza virus HLA-B*4405-restricted HA epitope candidates: implications for TCR cross-recognition and vaccine development

机译：2009-H1N1和2004-H5N1流感病毒HLA-B * 4405限制的HA表位候选物的分子对接分析：对TCR交叉识别和疫苗开发的影响
- 作者：Chinh TT Su;Christian Sch?nbach;Chee-Keong Kwoh
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第2期
56.An improved sequence based prediction protocol for DNA-binding proteins using SVM and comprehensive feature analysis

机译：使用SVM和综合特征分析的DNA结合蛋白基于序列的改进预测协议
- 作者：Chuanxin Zou;Jiayu Gong;Honglin Li
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
57.An enhanced computational platform for investigating the roles of regulatory RNA and for identifying functional RNA motifs

机译：一个增强的计算平台，用于研究调节性RNA的作用并鉴定功能性RNA基序
- 作者：Tzu-Hao Chang;Hsi-Yuan Huang;Justin Bo-Kai Hsu;Shun-Long Weng;Jorng-Tzong Horng;Hsien-Da Huang
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第2期
58.Robust flux balance analysis of multiscale biochemical reaction networks

机译：多尺度生化反应网络的鲁棒通量平衡分析
- 作者：Yuekai Sun;Ronan MT Fleming;Ines Thiele;Michael A Saunders
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
59.Data mining tools for Salmonella characterization: application to gel-based fingerprinting analysis

机译：用于沙门氏菌鉴定的数据挖掘工具：在基于凝胶的指纹分析中的应用
- 作者：Wen Zou;Hailin Tang;Weizhong Zhao;Joe Meehan;Steven L Foley;Wei-Jiun Lin;Hung-Chia Chen;Hong Fang;Rajesh Nayak;James J Chen
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第14期
60.Acceleration of sequence clustering using longest common subsequence filtering

机译：使用最长公共子序列过滤的序列聚类加速
- 作者：Youhei Namiki;Takashi Ishida;Yutaka Akiyama
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第8期
61.Computational framework to support integration of biomolecular and clinical data within a translational approach

机译：支持在转化方法中整合生物分子和临床数据的计算框架
- 作者：Newton Shydeo B Miyoshi;Daniel G Pinheiro;Wilson A Silva;Joaquim C Felipe
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
62.In silico investigation into dendritic cell regulation of CD8Treg mediated killing of Th1 cells in murine experimental autoimmune encephalomyelitis

机译：在计算机上研究小鼠实验性自身免疫性脑脊髓炎中CD8Treg介导的Th1细胞杀伤的树突状细胞调节
- 作者：Richard A Williams;Richard Greaves;Mark Read;Jon Timmis;Paul S Andrews;Vipin Kumar
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第6期
63.Correlation of geographical distribution of mycobacteriophages with genomic clusters and genome distance

机译：分枝杆菌噬菌体的地理分布与基因组簇和基因组距离的相关性
- 作者：Miranda L Parrish;Claire A Rinehart
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第17期
64.Compact representation of k-mer de Bruijn graphs for genome read assembly

机译：用于基因组读取组装的k-mer de Bruijn图的紧凑表示
- 作者：Einar A R?dland
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
65.A model of the circadian clock in the cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142

机译：蓝藻蓝藻属中昼夜节律的模型。 ATCC 51142
- 作者：Nguyen Xuan Vinh;Madhu Chetty;Ross Coppel;Sandeep Gaudana;Pramod P Wangikar
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第2期
66.Using ancestral information to detect and localize quantitative trait loci in genome-wide association studies

机译：在全基因组关联研究中使用祖先信息检测和定位定量性状基因座
- 作者：Katherine L Thompson;Laura S Kubatko
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
67.ScreenSifter: analysis and visualization of RNAi screening data

机译：ScreenSifter：RNAi筛选数据的分析和可视化
- 作者：Pankaj Kumar;Germaine Goh;Sarawut Wongphayak;Dimitri Moreau;Frédéric Bard
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
68.Inferring microRNA and transcription factor regulatory networks in heterogeneous data

机译：推断异构数据中的microRNA和转录因子调控网络
- 作者：Thuc D Le;Lin Liu;Bing Liu;Anna Tsykin;Gregory J Goodall;Kenji Satou;Jiuyong Li
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
69.Biomimicry of quorum sensing using bacterial lifecycle model

机译：使用细菌生命周期模型进行群体感应的仿生
- 作者：Ben Niu;Hong Wang;Qiqi Duan;Li Li
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第8期
70.A systematic comparison of the MetaCyc and KEGG pathway databases

机译：MetaCyc和KEGG途径数据库的系统比较
- 作者：Tomer Altman;Michael Travers;Anamika Kothari;Ron Caspi;Peter D Karp
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
71.Network-based differential gene expression analysis suggests cell cycle related genes regulated by E2F1 underlie the molecular difference between smoker and non-smoker lung adenocarcinoma

机译：基于网络的差异基因表达分析表明，E2F1调控的与细胞周期相关的基因是吸烟者与非吸烟者肺腺癌之间分子差异的基础
- 作者：Chao Wu;Jun Zhu;Xuegong Zhang
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
72.SASD: the Synthetic Alternative Splicing Database for identifying novel isoform from proteomics

机译：SASD：合成替代剪接数据库，用于从蛋白质组学中鉴定新型同工型
- 作者：Fan Zhang;Renee Drabier
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第14期
73.An optimized algorithm for detecting and annotating regional differential methylation

机译：一种检测和注释区域差异甲基化的优化算法
- 作者：Sheng Li;Francine E Garrett-Bakelman;Altuna Akalin;Paul Zumbo;Ross Levine;Bik L To;Ian D Lewis;Anna L Brown;Richard J D’Andrea;Ari Melnick;Christopher E Mason
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第5期
74.Ensemble-based prediction of RNA secondary structures

机译：基于集成的RNA二级结构预测
- 作者：Nima Aghaeepour;Holger H Hoos
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
75.Evaluation and integration of existing methods for computational prediction of allergens

机译：对过敏原计算预测的现有方法进行评估和整合
- 作者：Jing Wang;Yabin Yu;Yunan Zhao;Dabing Zhang;Jing Li
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第4期
76.PASTA: splice junction identification from RNA-Sequencing data

机译：PASTA：RNA序列数据中的剪接连接鉴定
- 作者：Shaojun Tang;Alberto Riva
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
77.ClusCo: clustering and comparison of protein models

机译：ClusCo：蛋白质模型的聚类和比较
- 作者：Michal Jamroz;Andrzej Kolinski
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
78.Learning smoothing models of copy number profiles using breakpoint annotations

机译：使用断点注释学习副本数配置文件的平滑模型
- 作者：Toby D Hocking;Gudrun Schleiermacher;Isabelle Janoueix-Lerosey;Valentina Boeva;Julie Cappo;Olivier Delattre;Francis Bach;Jean-Philippe Vert
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
79.DaGO-Fun: tool for Gene Ontology-based functional analysis using term information content measures

机译：DaGO-Fun：使用术语信息内容量度的基于基因本体的功能分析工具
- 作者：Gaston K Mazandu;Nicola J Mulder
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
80.In silico experimental evolution: a tool to test evolutionary scenarios

机译：计算机模拟实验演变：测试进化场景的工具
- 作者：Bérénice Batut;David P Parsons;Stephan Fischer;Guillaume Beslon;Carole Knibbe
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第15期
81.A novel subgradient-based optimization algorithm for blockmodel functional module identification

机译：一种基于次梯度的块模型功能模块辨识优化算法
- 作者：Yijie Wang;Xiaoning Qian
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第2期
82.Cheminformatic models based on machine learning for pyruvate kinase inhibitors of Leishmania mexicana

机译：基于机器学习的墨西哥利什曼原虫丙酮酸激酶抑制剂的化学信息学模型
- 作者：Salma Jamal;Vinod Scaria
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
83.An efficient post-hoc integration method improving peak alignment of metabolomics data from GCxGC/TOF-MS

机译：一种高效的事后积分方法，可改善来自GCxGC / TOF-MS的代谢组学数据的峰比对
- 作者：Jaesik Jeong;Xiang Zhang;Xue Shi;Seongho Kim;Changyu Shen
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
84.Infection status outcome, machine learning method and virus type interact to affect the optimised prediction of hepatitis virus immunoassay results from routine pathology laboratory assays in unbalanced data

机译：感染状态结果，机器学习方法和病毒类型相互影响，影响常规病理实验室分析中不平衡数据对肝炎病毒免疫分析结果的优化预测
- 作者：Alice M Richardson;Brett A Lidbury
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
85.Testing robustness of relative complexity measure method constructing robust phylogenetic trees for Galanthus L. Using the relative complexity measure

机译：测试相对复杂度测量方法的稳健性为Galanthus L建立稳健的系统树的方法
- 作者：Yasin Bak??;Hasan H Otu;Nivart Ta???;Cem Meydan;Ne?’e Bilgin;S?rr? Yüzba??o?lu;O U?ur Sezerman
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
86.DNdisorder: predicting protein disorder using boosting and deep networks

机译：DN疾病：使用加强和深度网络预测蛋白质疾病
- 作者：Jesse Eickholt;Jianlin Cheng
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
87.Pathway-based drug repositioning using causal inference

机译：使用因果推理的基于途径的药物重新定位
- 作者：Jiao Li;Zhiyong Lu
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第16期
88.Genome-wide probabilistic reconciliation analysis across vertebrates

机译：整个脊椎动物的全基因组概率和解分析
- 作者：Owais Mahmudi;Joel Sj?strand;Bengt Sennblad;Jens Lagergren
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第15期
89.Conversion of KEGG metabolic pathways to SBGN maps including automatic layout

机译：将KEGG代谢途径转换为SBGN图，包括自动布局
- 作者：Tobias Czauderna;Michael Wybrow;Kim Marriott;Falk Schreiber
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2013年第1期
90.Identification of single-stranded and double-stranded dna binding proteins based on protein structure

机译：基于蛋白质结构鉴定单链和双链dna结合蛋白
- 作者：Wei Wang;Juan Liu;Xionghui Zhou
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第12期
91.Exploiting dependencies of pairwise comparison outcomes to predict patterns of gene response

机译：利用成对比较结果的依赖性来预测基因应答模式
- 作者：Nam S Vo;Vinhthuy Phan
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第11期
92.Knowledge-based extraction of adverse drug events from biomedical text

机译：从生物医学文本中基于知识的不良药物事件提取
- 作者：Ning Kang;Bharat Singh;Chinh Bui;Zubair Afzal;Erik M van Mulligen;Jan A Kors
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第1期
93.Homology-based prediction of interactions between proteins using Averaged One-Dependence Estimators

机译：基于均一性的蛋白质平均相互作用预测
- 作者：Yoichi Murakami;Kenji Mizuguchi
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第1期
94.ILP-based maximum likelihood genome scaffolding

机译：基于ILP的最大似然基因组支架
- 作者：James Lindsay;Hamed Salooti;Ion M?ndoiu;Alex Zelikovsky
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第9期
95.IFACEwat: the interfacial water-implemented re-ranking algorithm to improve the discrimination of near native structures for protein rigid docking

机译：IFACEwat：界面水实现的重新排序算法，可提高对蛋白质刚性对接的近乎天然结构的区分
- 作者：Chinh Tran-To Su;Thuy-Diem Nguyen;Jie Zheng;Chee-Keong Kwoh
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第16期
96.ICoVax 2013: The 3rd ISV Pre-conference Computational Vaccinology Workshop

机译：ICoVax 2013：第三届ISV会议前计算疫苗学研讨会
- 作者：Anne S De Groot;Phoebe De Groot;Yongqun He
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第4期
97.Recognizing flu-like symptoms from videos

机译：从视频中识别流感样症状
- 作者：Tuan H Thi;Li Wang;Ning Ye;Jian Zhang;Sebastian Maurer-Stroh;Li Cheng
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第1期
98.GMOseek: a user friendly tool for optimized GMO testing

机译：GMOseek：用于优化GMO测试的用户友好工具
- 作者：Dany Morisset;Petra K Novak;Darko Zupani?;Kristina Gruden;Nada Lavra?;Jana ?el
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第1期
99.The Risa R/Bioconductor package: integrative data analysis from experimental metadata and back again

机译：Risa R / Bioconductor软件包：来自实验元数据的集成数据分析，然后再返回
- 作者：Alejandra González-Beltrán;Steffen Neumann;Eamonn Maguire;Susanna-Assunta Sansone;Philippe Rocca-Serra
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第1期
100.Comparative evaluation of gene set analysis approaches for RNA-Seq data

机译：基因组分析方法对RNA-Seq数据的比较评估
- 作者：Yasir Rahmatallah;Frank Emmert-Streib;Galina Glazko
- 期刊名称：《BMC Bioinformatics》 | 2014年第1期

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