矩阵填充结合相似性约束的抗癌药物敏感性预测

目录

声明

第1章 绪论

1.1 课题背景及研究目的和意义

1.1.1 课题背景

1.1.2 研究目的和意义

1.2 国内外研究现状

1.3 论文主要研究内容和基本框架

第2章 基于矩阵填充的抗癌药物敏感性预测模型

2.1 数据源及预处理

2.1.1 数据源

2.1.2 预处理

2.2 基于矩阵填充结合相似性约束的预测模型——MSD模型

2.2.1 模型构建

2.2.2 相似性约束

2.3 模型算法推导

2.3.1 矩阵分解

2.3.2 矩阵填充算法

2.3.3 相似性约束求解

2.4 本章小结

第3章 MSD模型结果分析和比较

3.1 交叉验证和评估指标

3.1.1 十折交叉验证

3.1.2 评估指标

3.2 优化模型

3.2.1 CCLE模型参数优化

3.2.2 GDSC模型参数优化

3.3 预测结果分析对比

3.3.1 CCLE结果分析和比较

3.3.2 GDSC结果分析和比较

3.4 本章小结

第4章 药物敏感性分类验证

4.1 分类预测药物敏感性问题

4.1.1 细胞系分类

4.1.2 实体肿瘤细胞系抗癌药物敏感性预测结果分析

4.2 药物敏感性分类

4.2.1 评价准则

4.2.2 分类验证结果对比

4.3 本章小结

结论

参考文献

附录

攻读硕士学位期间承担的科研任务与主要成果

致谢