红肉火龙果TST基因家族的生物信息学分析

摘要

为分离参与红肉火龙果果实可溶性糖积累的功能基因,基于转录组测序数据克隆液泡糖转运蛋白(Tonoplast sugar transporter,TST)基因家族,进行序列同源性、跨膜结构、亚细胞定位和系统发育等生物信息学分析.结果 表明:红肉火龙果含有4个TST基因,开放读码框(open reading frame,ORF)长度为2 127～2 235 bp,编码长度为708～744个氨基酸的序列.预测等电点为4.84～5.36,相对分子量为75.7～80.4 kDa;红肉火龙果TST家族氨基酸序列与甜菜和藜麦TST家族具有74.9％～83.4％的相似性;红肉火龙果TST成员均含11～12个跨膜结构域,定位于质体、叶绿体、液泡或内质网等细胞器.系统进化分析表明HpTST1属于TST1类,HpTST2.1和HpTST2.2属于TST2类,HpTST3属于TST3类.