广西地区原发性肉碱缺乏症新生儿筛查代谢谱及基因变异分析

摘要

目的分析广西地区原发性肉碱缺乏症（primary carnitine deficiency, PCD）新生儿筛查代谢谱和基因变异谱, 了解广西地区人群的患病率和基因变异特点。方法采用串联质谱技术（MS/MS）对广西新生儿疾病筛查中心辖区内从2014年1月至2019年12月行新生儿遗传代谢病筛查的400 575份样本进行分析, 初筛阳性者召回新生儿和其母亲复筛, 复筛仍阳性者行SLC22A5基因检测。结果共确诊PCD新生儿22例（患病率为1/18 208）, 母亲9例。对其中22例（18例新生儿和4例母亲）行基因检测, 发现SLC22A5基因14种44个变异位点, 其中变异频率最高分别为c.51C＆G（10/44, 22.7%）、c.1195C＆T（9/44, 20.5%）和c.1400C＆G （7/44, 15.9%）变异, 所有变异均为致病性;同时发现2种未报道的新变异c.1031C＆T和c.517delC, 根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南, c.517delC（p.Leu173Cysfs*3）变异被评估为致病（PVS1+PM2supporting+PM3+PP4）, c.1031C＆T（p.T344I）变异被评估为可能致病（PM1+PM2supporting+PM3+PP3+PP4）。结论 c.51C＆G、c.1195C＆T和c.1400C＆G为广西地区的热点变异。