声明
摘要
缩略词
第一章绪论
1.1海洋微生物多样性的研究进展
1.2微生物培养的限制因素
1.3微生物分离培养策略
1.3.1模拟自然环境的培养方法
1.3.2富集培养法
1.4细菌休眠及复苏研究现状
1.5宏转录学技术在微生物组中的应用
1.5.1宏基因组学
1.5.2宏转录组学
1.6立项依据
第二章宏转录组分析富集过程中微生物的活跃程度
2.1实验材料
2.1.1实验对象
2.1.2培养基与溶液
2.1.3主要试剂
2.2.3细菌16S rRNA基因的扩增与鉴定
2.2.4菌种保藏
2.2.5宏转录组测序实验流程
2.2.6生物信息学分析
2.3实验结果
2.3.1数据质量的控制
2.3.2宏转录组测序中物种组成分析
2.3.3样品微生物群落结构比较分析
2.3.4富集过程中微生物基因表达模块分析
2.3.5富集培养过程中关键基因应答分析
2.3.6富集培养过程中关键类群应答情况
2.4本章小结
第三章一株海洋滑动菌VBNC的诱导及复苏
3.1实验材料
3.1.1样品和菌株
3.1.2培养基
3.1.3实验试剂
3.1.4实验仪器
3.2实验方法
3.2.1鲑色海洋滑动菌VBNC状态的诱导方法
3.2.3鲑色海洋滑动菌的稀释涂布及VBNC状态的判定方法
3.2.4鲑色海洋滑动菌的休眠状态的复苏实验
3.3实验结果与分析
3.3.1鲑色海洋滑动菌的休眠状态的诱导
3.3.2鲑色海洋滑动菌的休眠状态的复苏实验
3.4本章小结
第四章三株新菌的多相分类
4.1实验材料
4.1.1样品和菌株
4.1.2培养基
4.1.3实验试剂
4.1.4实验仪器
4.2实验方法
4.2.2生理生化特征的测定
4.2.3基于遗传学的鉴定
4.2.4化学组分测定
4.3实验结果与分析
4.3.1海螺菌(Marinospirillum perlucida)F3212T的多相分类鉴定
4.3.2水生水弯曲菌(Aquiflexum aquatile)Z0201T的多相分类鉴定
4.3.3玫瑰单孢菌(Roseomonas bellus)CQN31T的多相分类鉴定
4.4文章小结
全文总结与展望
参考文献
附录
致谢
资助情况
攻读硕士期间发表的论文