一种利用宏基因组或宏转录组检测微生物的分析方法

摘要

本发明公开了一种利用宏基因组或宏转录组检测微生物的分析方法。所述分析方法对测序下机数据进行数据质控，过滤后得到高质量数据，然后并行进行组装和双端拼接(单端则不拼接)，组装和拼接所得数据基于bwa算法比对到微生物参考数据库，鉴定样本内微生物物种及其丰度信息。过滤低质量结果后整合分析结果。本发明方法适用范围广，能检测多种类型微生物，兼容多种主流测序平台，兼顾单端、双端测序数据及长读长、短读长序列数据特点，可从各类型测序数据准确地分析样本内微生物物种及其丰度。本发明方法能够有效降低假阳性，克服大部分微生物无法培养的难点，准确、快速、全面检测各类型样本内微生物。