超声异常胎儿全基因组SNP分型芯片检测结果分析与探讨

摘要

目的：全基因组芯片技术是近几年发展起来的是一种新型的细胞遗传分析方法,对于一些不明原因智力发育迟缓、多发畸形的患儿,芯片检测的阳性率要比常规染色体核型分析的阳性率高.应用该技术对62例B超提示发育异常的胎儿(先天性心脏病16例、单脐动脉4例、多发畸形20例、多囊肾2例、颅脑发育异常3例、唇腭裂3例、其它异常14例)取脐血进行检测,进一步探讨该方法在临床遗传诊断中应用的可行性及其优越性.rn 方法：对孕中期系统B超提示胎儿发育异常就诊的62例孕妇,取脐血进行培养、染色体分析并提取DNA进行全基因组SNP分型芯片检测.rn 结果：62例B超异常胎儿，G显带核型异常2例，其余均正常。芯片共检测出染色体微缺失或重复13例(20.9%)(先天性心脏病4例。多发畸形6例，多囊肾、短肢畸形、胎儿水肿各1例)。rn 讨论：染色体结构异常(缺失、重复、易位、倒位染色体)及数目异常是导致胎儿发育迟缓、畸形、流产、死胎的重要原因。以往的检测方法主要有染色体核型G显带和荧光原位杂交技术。G显带技术主要依靠显微镜下的形态特征来判断，对于<5M的染色体结构变化无法检出。FISH需要事先了解染色体可能存在的异常，每次只能对几个染色体异常位点进行检测。2010年美国医学遗传协会公布指南，将基因芯片定为不明原因智力落后，多发畸形不能确诊的综合征、孤独症、发育迟缓的一线首选检测技术。全基因组芯片扫描技术是一种新型的细胞遗传分析方法，对于一些不明原因智力落后、多发畸形的患儿，芯片检测无疑可以弥补传统检测手段的不足。我们运用全基因组SNP分型芯片对62例B超异常的胎儿脐血标本进行检测。异常13例，其中16例先天性心脏病标本中检测到异常4例:多发畸形22例，检测到异常6例;多囊肾、短肢畸形、胎儿水肿各检出异常1例。其中1例B超提示先天性心脏病，脐血穿刺后培养，G显带提示18P，基因芯片检测验证了这一结果，18p11.2-11.32区域存在14.34Mbp缺失。而对于B超提示涉及多个组织或器官畸形的标本，G显带核型均正常，利用芯片技术共检测出6例(27.3%)染色体亚微结构的异常。由此可见，对传统细胞遗传学技术检测结果正常而表型异常的患儿，非常有必要利用高分辨率的全基因组芯片技术进行新的研究。在分子细胞遗传学诊断中，全基因组芯片技术有较大的可行性和优越性。与其它传统的遗传学检测技术手段相比，Array SNP具有高通量、高分辨率、操作简单、特异性强等优点。不过，Array SNP也存在一些缺点，比如不能检测出平衡易位，相对成本较高，某些异常的临床意义尚难以确定，需要积累数据。但是，全基因组芯片技术的发展将会进一步推进先天性疾病研究及产前诊断的发展。