一种高效快速分离T‑DNA插入位点侧翼序列的方法及其用途

摘要

本发明提供了一种高效快速分离T‑DNA插入位点侧翼序列的方法，包括提取农杆菌介导的转基因植株的基因组DNA；将基因组DNA片段化，DNA修复、加A和连接后，利用磁珠进行片段选择后进行文库构建，构建的文库与T‑DNA边界序列进行杂交捕获以后进行PCR富集；对文库进行高通量测序，对测序数据进行生物信息学分析，获取T‑DNA插入位点。本发明利用靶标DNA捕获，专门针对T‑DNA边界序列进行低通量测序，本发明的方法克服了现有侧翼序列分离技术通量低，效率低和成功率低的不足，结合DNA捕获和第二代测序技术，特异性对T‑DNA边界序列进行测序并通过简单分析就能获得T‑DNA插入位点的侧翼序列，具有高效，经济和分析简单的特点。