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Single-cell analysis of a mutant library generated using CRISPR-guided deaminase in human melanoma cells

机译:使用CRISPR引导的脱氨酶在人黑素瘤细胞中生成的突变文库的单细胞分析

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摘要

Schematic flow of our platform. Types of introducible mutations. Thirteen of the canonical amino acids can be converted to another amino acids. Fraction of each introducible type of mutation. Targeted cytosine to thymine substitution efficiency in the “activity window” of the base editor. Solid line represents the median, with the upper and lower limits of each box corresponding to the 75 and 25% quantiles of the data. All p-values determined by two-sided Student’s -test, **  n = 4 independent base positions). Allele frequency of the E203K mutation before and 25 days after drug treatment. Efficiency of cytosine substitution according to position in the protospacer of the sgRNA.
机译:我们平台的流程示意图。可引入突变的类型。十三种规范氨基酸可以转化为另一种氨基酸。每种可引入类型的突变的分数。在基本编辑器的“活动窗口”中将胞嘧啶对胸腺嘧啶的替代效率设为目标。实线表示中位数,每个框的上限和下限分别对应于数据的75%和25%分位数。所有p值均由双面学生测试-** n = 4个独立的基本位置决定)。药物治疗之前和之后25天E203K突变的等位基因频率。根据sgRNA原型间隔子中位置的胞嘧啶取代效率。

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