西藏冬青稞种质资源SNP标记的遗传多样性分析

摘要

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是等位基因间序列差异最为普遍的类型,可作为一种高通量的遗传标记.利用IlluminaiSelect 9k SNP芯片对96个西藏冬青稞种质资源进行了SNP检测.结果表明,在分布于7条染色体上的7000个SNP位点中,5026个检测到了多态性,多态性比率为71.8％;SNP聚类分析将96份西藏冬青稞种质资源聚成七大类群,种质资源间的遗传相似系数(GS),其变异范围为0.288～0.999,平均值为0.771.96份西藏冬青稞种质资源间亲缘关系较近,遗传基础比较单一.