不同物种Mchr1基因编码区生物信息学分析

摘要

采用比较基因组学和生物信息学的方法分析了人、黑猩猩、玻利维亚灰鼠猴、猕猴、蒙眼貂、裸鼢鼠、佛罗里达海牛、小家鼠、小马岛猬共9个物种的黑色素浓集激素受体1(Mchr1)基因编码区(CDS)的遗传多样性,并对其氨基酸序列、蛋白结构等进行预测.结果表明,来自9个物种的44个Mchr1基因序列中共检测到多态位点200个,其中单一多态位点81个,单倍型14种,Mchr1基因CDS在种内表现较为保守,种间则表现出较丰富的遗传多样性.Mchr1蛋白为疏水性蛋白,理论等电点均大于7,肽链的不稳定系数介于36.26～44.21,均较稳定.Mchr1蛋白位于细胞质中.