中国绵羊群体mtDNA D-loop的遗传多样性分析

摘要

为了研究中国家养绵羊的起源和遗传多样性,通过对143只绵羊(9个群体)的线粒体DNA(mtDNA)D-环的部分序列进行PCR扩增,获得1个长度为723 bp的序列(含5个75 bp的重复单元),137个长度为648 bp的序列(含4个75 bp的重复单元),5个长度为573 bp的序列(含3个75 bp的重复单元),因此认为含有4个重复单元是家养绵羊mtDNA D-环的特征,mtDNA序列长度的变异主要是由于重复区重复单元次数的不同造成.对137个含有4个重复单元的序列进行分析,发现了157个变异位点,占研究位点的24.22 %.A、T、G、C含量分别为35.67 %、27.85 %、13.84 %和22.64 %.137个序列共发现96个单倍型,单倍型比例为70.07 %,说明中国家养绵羊具有丰富的mtDNA D-环序列多态性.96个单倍型序列的系统发育树呈现出3个明显的分支,网络分析也分为明显的三支,因此认为中国家养绵羊有3个母系起源.从Genebank获得的91个绵羊D-环序列和中国的96个绵羊D-环单倍型序列研究表明,摩佛伦(Mouflon)与单倍型B聚为一类,说明摩佛伦与中国家养绵羊具有很近的亲缘关系.没有发现羱羊(Ovis ammon argali)、盘羊(O. vignei bochariensis)和东方盘羊(O. ammon nigrimontana)对中国和蒙古家养绵羊起源有贡献的证据.