敦化市2009-2011年致手足口病流行肠道病毒71型基因特征分析

摘要

目的分析吉林省敦化市流行的肠道病毒71型分离株的基因特征。方法对2009—2011年敦化市手足口病来源的3株EV71分离株进行逆转录一聚合酶链反应扩增VP1基因编码区后进行序列测定，并使用Bioedit和Maga4生物信息学软件进行基因特征分析。结果敦化市3株EV71流行株均为C4a基因亚型，3株EV71分离株之间核苷酸同源性为98．6％～98．8％；与吉林省和龙市的流行株核苷酸同源性为98．8％～99．8％，与吉林省其他地区的2株EV71代表株的核苷酸同源性为97．6％～99．3％，与安徽省阜阳市2008年代表株的核苷酸同源性为98．3％～99．3％。敦化市3株EV71分离株之间、与2008年阜阳株以及吉林省2009—2011年3株代表株的氨基酸同源性均达到100％。结论敦化市3株EV71分离株与同为延边州的和龙市的流行株核苷酸同源性最高，与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸也具有较近的同源性。敦化市3株EV71分离株之间以及与中国C4a基因型代表株之间都具有较高的氨基酸同源性。