2010年南京市手足口病患儿的病原构成及肠道病毒71型分子流行病学特征分析

摘要

目的研究2010年南京市手足口病的病原构成及肠道病毒71型（EV71）VP1编码区基因特征。方法 采集南京儿童医院手足口病住院患儿的248份咽拭子标本,进行病毒分离,然后利用real-timePCR法对阳性分离物进行肠道病毒属、EV71和柯萨奇病毒A16型（Cox A16）鉴定。选取临床诊断为普通型病例、重型病例和危重型病例的EV71共20株进行VPI编码基因区基因扩增及核苷酸序列测定和分析,然后与EV71各基因型和基因亚型的代表株构建亲缘性进化树。结果 248份咽拭子标本共分离出146株病毒分离物。其中110株EV71,阳性率为44.35%,28株Cox A16,阳性率为11.29%,其他肠道病毒8株,占3.23%。对20株EV71进行VP1区核苷酸和氨基酸分析,发现其同源性较高,分别为95.51%～100%和98.32%～1 00%。构建亲缘性进化树显示20株EV71与C4基因亚型的代表株处于同一分支,属于C4基因亚型。结论南京地区2010年手足口病病原以EV71为主,且流行基因型为C4基因亚型;不同病例分型的EV71在VP1区未发现明显差异。