应用高密度单核苷酸多态性芯片分析胰腺癌细胞基因缺失

摘要

目的 探索胰腺癌癌变过程中的基因异常,研究胰腺癌基因组的纯合性缺失.方法 应用高密度单核苷酸多态性芯片.检测17种胰腺癌细胞株基因组的纯合性缺失,并利用分析软件进行数据分析,用PCR验证纯合性缺失位点.结果 17种胰腺癌细胞基因组中,发现70个区域纯合性缺失,其中28个区域无已知基因,42个区域有基因.35个区域经过PCR验证.29个区域经证实为纯合性缺失,芯片的准确度为82.9%,其中最小缺失区域为6 kb.结论 应用高解析度的SNP基因芯片可以检测胰腺癌全基因组范围内的精细的纯合性缺失位点.