长非编码RNA鉴定方法研究

摘要

高通量测序技术的出现带来了大量可用的转录组数据,评估进化保守区域的编码潜力成为转录数据分析中的核心任务。对转录本编码潜力的预测可以用来鉴定长非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)。lncRNA是一种长度超过200个核苷酸的非编码RNA,研究表明lncRNA在多种生物中都有重要作用,能够在染色质修饰、表观遗传、转录及转录后调控等多种层面发挥重要的调控作用。已经有许多基于机器学习的工具被开发用来区分编码与非编码转录本序列。不同的工具通常是针对不同的情况设计的,因此需要根据特定的情况选择合适的方法。本文分析了几种常用工具各自的特点和适用范围,帮助研究人员选用合适的方法以获得更可靠的结果。