高等植物ANS的生物信息学分析

摘要

采用生物信息学方法对GenBank中甘蓝、葡萄、普通小麦、西洋梨等的花青素合成酶基因的cDNA序列及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、功能域和进化关系进行预测和分析。结果表明:不同植物ANS cDNA序列的起始密码子ATG,终止密码子均为TAG、TGA或TAA。氨基酸残基数及分子量均基本一致。氨基酸序列中含量最高的氨基酸均为Glu和Leu。植物ANS cDNA序列编码的氨基酸序列的理论等电点、酸性和碱性氨基酸的比例、半衰期、摩尔消化系数、带点氨基酸比例均基本一致。植物在肽链中的分布均是亲水性氨基酸数量多于疏水性氨基酸。整个多肽链表现为亲水性,无明显疏水区域,属于亲水蛋白。所有植物的ANS整条肽链均在膜外,所有ANS都不存在跨膜区域。