基于线粒体DNA D-loop序列的五华三黄鸡遗传多样性及其品种起源研究

摘要

通过PCR产物直接测序法对五华三黄鸡保种群120个个体进行线粒体DNA(mtDNA)D-loop序列测定,研究该品种的遗传多样性和系统进化.结果显示,五华三黄鸡保留着较高水平的遗传多样性.mtDNA D-loop的C+G含量(42.5％)低于T+A含量(57.5％),核苷酸多样性和核苷酸差异均数分别为0.01298±0.00051和6.750.共检测到33个突变位点,均为转换突变,包括23个T>C转换和10个A>G转换,占分析位点的6.35％.定义了32种单倍型,其中独享型单倍型19个,单倍型多样性为0.913±0.012,遗传距离为0.013±0.003.单倍型类群主要分布在进化枝A、B、C和E,其中B为优势单倍型类群.系统进化分析和进化枝地理分布特征表明,五华三黄鸡有4个母系来源,可能受北方家鸡南迁的影响.