应用Illumina MiSeq测序技术比较风干肉中细菌多样性和微生物安全性

摘要

为了解风干肉制品中细菌的多样性及其微生物的安全性,采用Illumina MiSeq高通量测序技术,分析风干肉制品中细菌16S rRNA V4区基因序列,进而比较不同风干肉微生物的群落结构组成及多样性差异.结果显示,14?个样品共获得466?975?条有效序列,975?个操作分类单元.多样性分析表明,自然发酵风干肉中具有高度的微生物群落多样性.微生物群落组成分析表明,自然发酵样品中厚壁菌门(Firmicutes,39%)、变形菌门(Proteobacteria,40%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,14%)为优势菌门,所占比例都超过了10%,人工调控样品中Firmicutes(92%)为优势菌门.在自然发酵和人工调控肉制品中分别鉴定出241?个和102?个细菌属,细菌多样性在属的水平上差异显著(P＜0.05).研究结果加深了对风干肉细菌群落组成和多样性的认识,为保证风干肉制品的质量安全、提高风干肉制品的品质、优化风干肉的生产工艺提供理论依据.