重庆地区耐多药结核分枝杆菌三种二线注射类药物耐药相关基因特征分析

摘要

目的分析重庆市耐多药结核病(MDR-TB)临床菌株二线注射类药物耐药相关基因突变特征,为本地区合理应用分子生物学技术进行注射类药物耐药性检测提供科学依据。方法收集2015年1月至2017年6月重庆市39个区(县)967例MDR-TB可疑患者的所有耐多药(MDR)结核分枝杆菌临床分离株229株,通过微孔板Alamar blue显色法检测3种二线注射类药物[卡那霉素(Km)、阿米卡星(Am)、卷曲霉素(Cm)]的耐药性,用PCR测序方法对其耐药相关基因rrs、eis启动子区、tlyA进行分析,并采用荧光定量熔解曲线方法进行北京基因型鉴定。结果在229株MDR菌株中,35株(15.3%,35/229)对三种二线注射类药物任一耐药,Km、Am和Cm耐药率分别为14.8%(34/229)、11.8%(27/229)、8.3%(19/229)。在34株Km耐药株中,21株发生rrs基因A1401G突变,1株rrs基因G1484T突变,4株eis启动子区G(-10)A突变及1株C(-14)T突变。在27株Am耐药株中,20株发生rrs基因A1401G突变,1株rrs基因G1484T突变,1株eis启动子区G(-10)A突变。在19株Cm耐药株中,13株发生rrs基因A1401G突变,1株rrs基因G1484T突变,1株tlyA基因137位碱基插入改变。北京与非北京基因型间注射类药物耐药及相关基因突变情况差异均无统计学意义。结论重庆地区MDR结核分枝杆菌Km、Am和Cm各耐药相关基因呈现不同的突变频率特征,其中rrs基因突变频率最高,可作为三种注射类药物的耐药诊断标记物。北京基因型与二线注射类药物耐药无相关性。