2015-2018年广东省猪流行性腹泻病毒M基因的遗传进化分析

摘要

本试验通过对22株采集于2015-2018年广东省内猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行株的M基因进行克隆和测序,并将测序结果与NCBI中PEDV参考株M基因进行同源性分析和构建系统进化树,从而了解广东省PEDV流行株的近年来遗传变异情况.结果 显示,22株PEDV流行株间核苷酸序列同源性为97.5％ ～ 100.0％,与华南地区参考株M基因核苷酸序列同源性为97.7％～99.9％,与国内较早分离株CH/S和经典毒株CV777同源性较低,分别为97.5％ ～98.1％、97.7％～ 98.2％.PEDV M基因遗传进化分析显示,22株广东PEDV流行株的同源性较高,亲缘关系紧密,此外,22株广东PEDV流行株与大部分代表性毒株、疫苗株亲缘关系较远,如国内早期分离株CH/S、经典毒株CV777、韩国株KRPEDV-9-Vaccine、泰国株M_NIAH100541_08、日本株JMe2、英国株Brl/87等.试验结果表明,广东省当前的PEDV流行毒株存在基因变异并形成独特进化分支.