纳米磁珠法与试剂盒法分析载脂蛋白E基因的多态性

摘要

背景：相对于血液标本，口腔拭子标本更利于大规模载脂蛋白E基因多态性分析的研究，但目前对口腔拭子标本基因组DNA的提取尚无统一方法。目的：探索合适的口腔拭子标本基因组提取方法以分析载脂蛋白E基因的多态性。方法：收集50例散发性阿尔茨海默病患者口腔拭子标本，每份标本分别应用纳米磁珠法与PicoDNA微量核酸提取试剂盒法提取基因组DNA，对比分析两种方法获得的基因组DNA纯度和浓度，后续进行PCR反应，应用DNA电泳确认有无成功扩增出目的条带，通过DNA测序方法分析载脂蛋白E基因的多态性。结果与结论：两种方法提取的基因组DNA纯度均较好，纳米磁珠法提取的基因组DNA浓度要高于PcioDNA微量核酸提取试剂盒法所得浓度（P〈0.05）。两组获取的基因组DNA均可成功进行PCR扩增，但电泳结果示纳米磁珠法扩增的目的条带更清楚。两组PCR产物DNA测序结果一致，载脂蛋白E基因ε2、ε3、ε4基因型的比例分别是6%，71%，23%。表明纳米磁珠法相对于PcioDNA微量核酸提取试剂盒法提取口腔拭子标本基因组DNA更适合用于大样本载脂蛋白E基因多态性的研究。