HCV基因型检测芯片的设计与研制初报

摘要

目的设计与研制丙型肝炎病毒(HCV)基因型检测芯片.方法用生物信息学方法设计HCV 5′UTR型特异性探针.按设计模式,以自动化微阵列点样仪将探针点样于APTES-PDC修饰的玻片表面.用商品PCR试剂盒掺入荧光分子对患者血清样本进行扩增,用激光共聚焦荧光扫描仪检测并分析结果.结果根据5′UTR序列设计了各型HCV的特异性探针.芯片表面修饰符合固定探针和杂交检测的需求.含荧光分子的RT-PCR产物可成功地与固定于芯片上的探针阵列杂交进行HCV基因型的检测.21例丙型肝炎患者中,19例为1b型,1例为2a型,1例为混和型.结论所设计研制的基因芯片可望成为检测HCV基因型的操作简便,结果准确,价格低,耗时短的新型实验室检测方法.