基于PCR-DGGE法分析酱菜中乳酸菌群落结构

摘要

文章以不同含盐量的酱菜为对象,通过聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术研究酱菜中乳酸菌的多样性.使用Quantity One软件进行DGGE凝胶图谱条带分析,得到酱菜样品中乳酸菌群落结构特征.研究结果说明,两种酱菜体系乳酸菌丰富度和多样性指数差异显著(P＜0.05),均匀度无显著差异(P＞0.05).通过回收DGGE电泳带,经过克隆后测定碱基序列,与GenBank序列对比鉴定,JB样品即高盐酱菜的PCR-DGGE泳带有3条,经鉴定,与γ-变形杆菌(γ-Proteobacterium)、乳酸杆菌(Lactobacillus)、非培养乳酸杆菌(Uncultured Lactobacillus)相似度分别为95％、97％、96％.JA样品即低盐酱菜的PCR-DGGE泳带有4条,经鉴定,与乳酸杆菌(Lactobacillus)、非培养乳酸杆菌(Uncultured Lactobacillus)、乳球菌属(Lactococcus sp.)、γ-变形杆菌(γ-Proteobacterium)相似度分别为97％、95％、97％、92％.研究结果表明食盐浓度影响微生物的群落结构.