一种提高水产动物全基因组选择育种效率的方法

摘要

本发明公开了一种适合水产的动物的全基因组选择育种方法，具体地，对育种基础群或核心群个体的进行高密度SNP分型，并测定其目标性状的表型值，利用SNP分型数据和表型数据进行全基因组关联分析(GWAS)分析，获得每个SNP标记的显著性P值，并将标记按照P值由低到高排序，根据不同的性状，按照P值选择排序靠前的不同标记数组合，利用全基因组选择分析方法包括GBLUP、BayesB等进行分析，通过交叉验证评估按照P值选择的不同标记数的预测准确性，最终确定出预测准确性最高的标记组合。利用筛选出的最优标记组合对候选群体或者下一代育种群体进行SNP分型，使用GBLUP、BayesB或者ssGBLUP等方法对候选群体或者下一代育种群体进行育种值预测，可以显著提高预测的准确性。