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一种基于贝叶斯网络推理的基因间交互关系挖掘方法

摘要

本发明提供一种基于贝叶斯网络推理的基因间交互关系挖掘方法,包括以下步骤:1、利用高斯核概率密度估计量估测熵的方法,计算基因与基因间、基因与表型性状间以及表型与表型性状间互信息;2、利用三阶段依赖分析贝叶斯网络结构学习方法,构建包含基因与表型性状节点的贝叶斯网络;3、利用贝叶斯估计参数学习方法进行参数学习,得到节点间条件概率表;4、利用吉布斯抽样贝叶斯网络近似推理方法计算不同个数的基因与表型性状间条件概率,根据计算结果大小得到影响特定表型性状的基因间交互关系。本发明可以帮助生物学研究者获得影响特定表型性状的上位性基因位点,进而辅助基因功能挖掘,以及为不同物种的复杂数量性状的遗传基础解析提供借鉴。

著录项

  • 公开/公告号CN109411023A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-03-01

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 华中农业大学;

    申请/专利号CN201811157185.1

  • 申请日2018-09-30

  • 分类号

  • 代理机构湖北武汉永嘉专利代理有限公司;

  • 代理人崔友明

  • 地址 430070 湖北省武汉市洪山区狮子山街1号

  • 入库时间 2024-02-19 08:24:48

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-03-26

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B40/00 申请日:20180930

    实质审查的生效

  • 2019-03-01

    公开

    公开

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