基于改进PSSM进行特征提取与融合的蛋白质亚核定位方法

摘要

本发明公开一种基于改进PSSM进行特征提取与融合的蛋白质亚核定位方法，涉及生物及信息技术领域。所述基于改进PSSM进行特征提取与融合的蛋白质亚核定位方法首先对蛋白质序列的进化信息采用Z‑SoftMax函数去规范化位置特异性得分矩阵；其次采用提出的SC‑PSSM‑C和SC‑PSSM‑R分别对位置特异性得分矩阵进行不同方向不同跳跃间隔下的特征提取，固定PSSM的长度；再利用改进的最大信息系数算法对融合后的特征进行特征选择，最后采用优化参数后的W‑SVM分类器进行最终的分类预测。本发明具有能弥补传统特征提取的局限性和单一性，提高了蛋白质亚核定位的能力。