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分子系統樹解析とマルチプレックスPCRを用いたAspergillus flavusグループの識別

机译:分子系统发育分析和多重PCR鉴定黄曲霉菌群

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摘要

We describe a simple method for discrimination of Aspergillus flavus group fungi, including aflatoxin (AF) producers, by means of molecular-biological analysis of 45 strains of A. flavus. First, 20 strains of A. flavus were compared using phylogenetic tree analysis based on the nucleotide sequences of ITS 1-5.8S-ITS 2 (ITS-1/2) and aflR-aflJ intergenic spacer (aflR/J-IGS), In this analysis, the tested strains were discriminated into 4 groups at the aflR/J-IGS region. Although ITS-1/2 region analysis could not discriminate between A. flavus (AF producers) and A. oryzae/A. flavus (AF nonproducers), aflR/J-IGS region analysis could discriminate between these groups. Moreover, 45 strains of A. flavus were compared by means of both phylogenetic tree analysis based on the aflR/J-IGS region and the conventional afiatoxin production test (culture method). The phylogenetic tree analysis of the tested strains was consistent with the findings of the culture method. In addition, 49 strains of A. flavus and related species (Aspergillus spp.) were tested by multiplex PCR with primers designed on the basis of the phylogenetic tree analysis. These results were consistent with phylogenetic tree analysis based on the aflR/J-IGS region for 41 strains.%アフラトキシン(AF)産生菌を含むAspergillus flavusグループの簡易な識別方法を構築するために,A. flavusグループ45株について分子生物学的な解析を行った.最初に,A. flavusグループ20株についてITS 1-5.8S-ITS 2(ITS-1/2)領域とaflR-aflJ intergenic spacer (aflR/J-IGS)領域の分子系統樹を比較した.その結果,aflR/J-IGS領域に基づいた解析ではITS-1/2領域の解析で識別できなかったA. flavus(AF産生株)とA.oryzae/A. flavus(AF非産生株)の識別が可能であった.また,A.flavusグループ45株を用いてaflR/J-IGS領域の分子系統樹解析と培養法によるアフラトキシン産生性を比較した.その結果,aflR/J-IGS領域の分子系統樹解析で推定されたアフラトキシン産生性と培養法で得られた結果が一致した.これら分子系統樹解析の結果に基づき設計したプライマーを用いてA.flavusを中心とした49株のAspergillus属菌を対象にマルチプレックPCR法による識別を試みた.その結果,供試41株でaflR/J-IGSの分子系統樹解祈と同様の結果が得られた.
机译:我们通过45种黄曲霉菌株的分子生物学分析,描述了一种区分黄曲霉菌群真菌(包括黄曲霉毒素(AF)生产者)的简单方法。首先,使用系统发育树分析方法,基于ITS 1-5.8S-ITS 2(ITS-1 / 2)和aflR-aflJ基因间隔子(aflR / J-IGS)的核苷酸序列,比较了20株黄曲霉菌株。通过该分析,将测试的菌株在aflR / J-IGS区域分为4组。尽管ITS-1 / 2区域分析无法区分黄曲霉(AF生产者)和米曲霉/ A。黄褐斑(AF非生产者),aflR / J-IGS区域分析可以区分这些人群。此外,通过基于aflR / J-IGS区域的系统进化树分析和常规的抗毒素生产测试(培养方法),比较了45个黄曲霉菌株。测试菌株的系统进化树分析与培养方法的发现是一致的。另外,通过多重PCR,使用基于系统进化树分析设计的引物,对49株黄曲霉和相关物种(曲霉属)进行了测试。这些结果与基于41个菌株的aflR / J-IGS区域的系统树分析结果是一致的。%AF产生菌を含む黄曲霉(Aspergillus flavusグルーなの简易な识别方法を构筑するために)。 flavusグループ45株について分子生物学的な解析を行った。最初に,A。 flavusグループ20株についてITS 1-5.8S-ITS 2(ITS-1 / 2)领域とaflR-aflJ基因间隔子(aflR / J-IGS)领域の分子系统树を比较を。その结果,aflR / J- IGS领域に基づいた解析ではITS-1 / 2领域の解析で识别できなかったA。 flavus(AF产生株)とA.oryzae / A。 flavus(AF非产生株)の识别が可能であった。また,A.flavusグループ45株を用いてaflR / J-IGS领域の分子系统树解析と培养法によるアフラトキシン产生性を比较した。その结果,aflR / J-IGS领域の分子系统树解析で推定されたアフラトキシン产生性と培养法で得られた结果が一致した。これら分子系统树解析の结果に基づき设计したプライマーを用いてA.flavusを中心とした49株のAspergillus属菌を対象にマルチプレックPCR法による识别を试みた。その结果,供试41株でaflR / J-IGSの分子系统树解祈と同様の结果が得られた。

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