基于焦磷酸测序研究雪豹肠道微生物多样性

摘要

通过采集健康成年雪豹的新鲜粪便样品,借助高通量焦磷酸测序技术对雪豹肠道微生物多样性进行研究,并进行个体间差异的比较,为雪豹的救护饲养和营养生态学研究提供资料。研究结果表明,雪豹粪便微生物共包括9个细菌门,18个纲,31个目,64个科,82个属。其中丰度最高的5个细菌门分别是厚壁菌门(Firmicutes)(26.58%—46.59%),放线菌门(Actinobacteria)(29.21%—46.59%),拟杆菌门(Bacteroidetes)(1.61%—16.26%),梭杆菌门(Fusobacteria)(2.03%—24.78%)和变形菌门(Proteobacteria)(3.10%—5.79%)。放线菌门的红蝽菌科(Coriobacteriaceae)是雪豹粪便微生物中丰度最高的科。除样品5之外,红蝽菌科(Coriobacteriaceae)的丰度在其他样品中均占OTU总数的40%以上。柯林斯氏菌属(Collinsella)是雪豹粪便微生物中丰度最高的属。多样性分析表明雪豹肠道微生物群落具有较大的个体差异。