豚鼠脑中表达的磷酸二酯酶基因cDNA序列的鉴定与分析（英文）

摘要

目的环核苷酸磷酸二酯酶（phosphodiesterase,PDE）是一氧化氮（nitric oxide,NO）信号转导途径中的一个关键成员,在认知与学习、帕金森病、注意缺陷多动障碍、精神病和抑郁症等过程中发挥重要作用。PDE在豚鼠脑中的表达情况还未见报道。本研究旨在对豚鼠脑中表达的Pde cDNA序列进行鉴定与分析。方法根据人PDE和小鼠Pde cDNA序列的22个保守区设计引物,采用RT-PCR法扩增豚鼠脑中表达的未知Pde基因cDNA部分序列,并采用生物信息学软件分析不同物种间Pde cDNA序列及氨基酸多肽序列的同源性及保守功能基序。结果在豚鼠脑中发现了11个新的Pde基因cDNAs,包括CpPde1a、CpPde1b、CpPde2a、CpPde4a、CpPde4d、CpPde5a、CpPde6c、CpPde7b、CpPde8a、CpPde9a和CpPde10a。豚鼠与人之间的Pde基因cDNA序列的同源率在83.8%-94.3%之间,氨基酸序列的同源率在91.9%-100%之间。豚鼠与小鼠之间的Pde基因cDNA序列的同源率在84.6%-92.1%之间,氨基酸序列的同源率在91.2%-99.2%之间。此外,这11个Pde cDNAs在豚鼠与人之间的平均同源率显著高于在豚鼠与小鼠之间的同源率（P〈0.01）。豚鼠的部分氨基酸序列具有至少一个人及小鼠PDE蛋白的保守功能区。结论这些发现为进一步研究PDE在大脑中的生理功能打下了基础。