H3N2亚型禽流感病毒分离鉴定及HA和NA基因序列分析

摘要

为了研究野生禽类H3N2亚型低致病性禽流感病毒的分子特征,本研究从野鸭粪便样本中分离到一株禽流感病毒,通过血凝抑制试验证实分离株为H3亚型流感病毒,命名为A/Mallard/Qiqihaer/0726/2013(H3N2).对其血凝素和神经氨酸酶基因进行了克隆和序列分析,核苷酸序列比对结果表明分离株HA基因与H3N8亚型A/Mallard/SanJiang/90/2006(H3N8)的同源性最高,达到99.5％,NA基因与H5N2亚型Aorthern pintail/Akita/714/2006(H5N2)的同源性最高,达到99.4％.系统发育树分析进一步证实分离株的HA和NA基因可能分别来自于H3N8亚型和H5N2亚型禽流感病毒,是一株重排病毒.本研究为H3N2亚型禽流感病毒的遗传进化机制提供了理论数据.