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子宫内膜异位症中的异常表达基因分析

         

摘要

目的 分析子宫内膜异位症(EM)患者高通量测序数据,探索异位内膜组织中基因的异常表达情况.方法 从GEO在线数据库获取EM患者在位内膜与异位内膜组织高通量测序数据,建立条件分析差异表达基因(DEGs),运用DAVID对DEGs进行注释,使用STING数据库进行DEGs编码蛋白间相互关系(PPI)分析,筛选出候选基因.35例EM患者纳入研究,采集在位内膜组织(对照组)与异位内膜组织(试验组),利用荧光定量PCR技术验证候选基因.结果 满足条件的DEGs共计826个,其中高表达161个,低表达665个.通过PPI分析,13个基因确定为用于后续验证的候选基因.经荧光定量PCR试验验证,试验组VWF、BMP4、GATA4基因表达量低于对照组,差异有统计学意义(P<0.01),试验组HOXB7、WNT2基因表达量高于对照组,差异有统计学意义(P<0.01).结论 VWF、BMP4、GATA4、HOXB7、WNT2基因可能直接参与EM的发生、发展,这些基因异常表达可能驱动子宫内膜表型改变.检测这些基因表达有望为揭示EM的发病机制提供科学依据.

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