适于草果遗传多样性分析的RAPD引物筛选

摘要

以云南省文山州西畴县和德宏州陇川县的12株草果优良无性系为材料,利用RAPD标记技术,选用192个RAPD随机引物,对草果进行PCR扩增,并用UPGMA法对RAPD引物扩增条带进行聚类分析,计算其遗传相似系数,以期筛选出适用于草果遗传多样性分析的RAPD有效引物.实验共筛选出21个条带清晰、 多态性丰富并具有可重复性特点的有效引物.21个引物在实验选用的12份样品中共扩增出177条DNA带,其中多态性带数为119条,占扩增总带数的67.2％,每个引物平均扩增出8.4条带.结果表明,12份草果样品聚为A组和B组,其中A组又分为两个亚组,聚类结果与所选用材料的地理来源基本一致,这也说明该研究所筛选得到的21个RAPD引物适用于草果的遗传多样性分析.该研究为应用RAPD标记技术对草果进行遗传多样性分析等研究奠定了基础.