Bright Yellow 2烤烟热激蛋白90生物信息学分析

摘要

【目的】分析Bright Yellow 2烤烟热激蛋白90（HSP90）的生物学信息，为揭示烘烤过程中烟叶的烘烤特性提供理论依据。【方法】从NCBI中获取BrightYellow2烤烟HSP90蛋白序列NtHSP-1、NtHSP-2和NtHSP-3（GenBank登录号分别为BAL42333、BAL42332和BAM24708），利用生物信息学软件对各序列进行理化特性、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、二级结构和三级结构预测分析。【结果】BrightYellow2烤烟NtHSP-1、NtHSP-2和NtHSP-3的氨基酸数量分别为812、811和699个，均以酸性氨基酸含量较多，其中谷氨酸（Glu）含量最高，理论等电点均小于5.00，二级结构均以α-螺旋（H）和无规则卷曲（C）为主。NtHSP-1和NtHSP-2的亲水性较高，具有较高的稳定性，属于分泌蛋白，具有锚定结构，定位于内质网，其三级结构呈现“r”形，N端内部具有Mg2+结合位点、HATPase_c（ATP酶）和top6b（DNA拓扑异构酶VI）功能域；NtHSP-3为非分泌型蛋白，定位于叶绿体，三级结构呈现“i”形，N端含有Mg2+结合位点和HATPase_c功能域。【结论】NtHSP-1和NtHSP-2可能与烟叶耐烤性有关，而NtHSP-3可能与烟叶易烤性有关。