基于数据挖掘分析HMGB1表达对胃癌预后的影响

摘要

目的 本文基于数据挖掘探索高迁移率族蛋白1(HMGB1)在胃癌中的表达及对预后的影响.方法 Oncomine数据库提取HMGB1在胃癌组织和正常组织中转录水平的变化数据,并对数据库中的基因表达信息进行二次分析;利用Kaplan-Meier Plotter分析HMGB1表达水平与胃癌预后的关系.结果 Oncomine数据库中共收集了443项不同类型的研究结果,其中关于HMGB1表达有统计学差异的研究结果有20项,HMGB1表达增高的研究有17项、表达降低的研究有3项,在胃癌中高表达的研究有1项,低表达的有0项.11项研究涉及HMGB1在胃癌组织和正常组织中的转录水平的表达,共包括318个样本,与正常组织相比,HMGB1在胃癌组织中高表达(P=0.002).不仅如此,Kaplan-Meier Plotter数据库分析结果显示,HMGB1的mRNA表达量与胃癌总体生存率存在相关性,即高表达HMGB1的患者总体生存率较好,低表达HMGB1的患者预后较差(P=1.8E-05).结论 HMGB1 mRNA在胃癌组织中高表达,而且与肠型胃癌预后相关,这为探索HMGB1在胃癌中的作用提供了基础,也为今后胃癌的临床治疗和预后研究提供重要理论依据.