网格蛋白抑制剂的虚拟筛选与活性评价

摘要

目的 基于网格蛋白发现内吞抑制剂或具有抗病毒活性的化合物.方法 以网格蛋白晶体结构为基础,利用分子对接对自有化合物库进行虚拟筛选,所获得的优选分子采用分子动力学模拟方法对受体-配体相互作用的动态过程进行分析,预测复合物的结合自由能并找出受体蛋白中的关键残基,通过细胞水平抗肠道病毒EV71的活性筛选、毒性测定及转铁蛋白内吞实验,对化合物的抗病毒活性及作用机制进行评价与验证.结果 获得了1个结构新颖且对EV71病毒有抗病毒作用的活性分子Cg20(IC50=24.88μmol/L),该化合物的细胞毒性低于阳性对照化合物pitstop2.结论 本文报道的虚拟筛选方法与活性预测模型已通过本研究生物学实验获得验证,可继续运用于网格蛋白抑制剂的设计与开发,研究结果为先导化合物Cg20提供了明确的优化方向,为网格蛋白抑制剂的高效开发提供了理论支撑.