CDK2别构小分子抑制剂的虚拟筛选和体外活性研究

摘要

目的根据CDK2的晶体结构(PDB ID:3PXF),在已验证的别构口袋处,拟筛选出CDK2新型别构小分子抑制剂。方法通过计算机辅助药物设计方法,基于CDK2蛋白晶体别构位点进行虚拟筛选,综合分析化合物与CDK2的作用模式;构建CDK2体外激酶活性检测体系,对化合物进行初步的体外生物活性研究。结果虚拟筛选得到打分前1 000名的化合物,最终挑选并购买10个候选化合物。其中,化合物S2和S5表现出较好的抑制效果,在100μmol/L的浓度下对CDK2活性的抑制率分别为57.59%和41.64%。结论综合利用虚拟筛选、结构分析以及生物活性测试,筛选出具有明显的CDK2抑制活性的先导化合物S2和S5,为设计开发新型的CDK2别构小分子抑制剂奠定了基础。