新环脂肽罗克霉素操纵子中的启动子活性研究

摘要

利用生物信息学和启动子连接报告基因方法阐明罗克霉素的启动子活性和转录因子作用区域,并对ploc启动子区域序列可能存在的调控蛋白进行生物学分析和预测.生物信息学分析发现ploc启动子可能存在11个调控蛋白(SigE、ResD、SpoⅢD、SigB、DegU、SigX、Spo0A、Hpr、AbrB、SigH、GerE)的结合位点.通过比较16个重组和对照菌株Bs916之间木聚糖酶活的差异,当切除启动子ResD和Hpr两个调控因子预测结合位点时,木聚糖酶活下降较明显;切除SpoⅢD和Spo0A调控因子预测结合位点时,木聚糖酶上升较明显.ResD及Hpr这两个蛋白调控因子在ploc启动子中起关键性的正调控作用;SpoⅢD和SpoAⅡ这两个蛋白调控因子在ploc启动子中起非常关键的负调控作用.对其分子调控机理及关键调控蛋白调控罗克霉素合成的具体作用方式需要进一步探索.