3个地理群体仿刺参D-loop序列的变异及系统发生分析

摘要

为研究中国大连(CD)、朝鲜罗津(KN)和俄罗斯海参崴(RV)3个仿刺参群体的遗传结构,实验采用PCR扩增和测序技术,对3个群体共计71头仿刺参的线粒体D-loop序列进行了分析.结果显示,D-loop序列长度为447 ～ 465 bp,平均A+T含量(59.2％)显著高于G+C含量;共检测到1 19个变异位点,多态位点比例为24.24％,其中简约信息位点为53个,共有40种基因型,群体共享基因型7个.遗传多样性参数分析显示,3个群体均显示出较丰富的遗传多样性;分子方差(AMOVA)分析表明,3个群体间遗传分化较弱或只有中度分化,且93.04％的变异来自群体内.CD群体与RV群体之间遗传距离最远,为0.042,KN群体与RV群体之间遗传距离最近,为0.037 4.将本研究所得序列结合GenBank中青岛(QD)和威海(WH)仿刺参的D-loop序列构建系统发育树,QD与WH仿刺参首先聚为一小支,然后与CD群体聚为一大支,KN群体与RV群体聚为独立一支,这一聚类方式符合地理隔离模式.