利用等位基因特异性PCR技术检测番茄高色素基因hp1和hp2的单核苷酸多态性

摘要

番茄(Lycopersicon esculentem)高色素基因hp1和hp2突变体与野生型基因相比均发生了单碱基的点突变,用常规PCR技术很难区分.实验对碱肇错配类型和位置与特异性PCR的关系进行了研究.结果表明,引入TA-TG双碱基错配的引物,退火温度在49.3±0.I℃时能把hp1基因的突变位点和野生型的对应位点区分开来.引入T-C碱基错配的引物,退火温度在53.5±0.1℃时能把hp2基因的突变位点和野生型的对应位点区分开来.错配碱基在引物3'端的位置对PCR的特异性影响不大.