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降解组测序与剪切位点分析研究进展

         

摘要

动植物细胞内都存在大量的microRNA(miRNA),miRNA的功能之一是通过互补指导内切酶切割与之互补的mRNA,对该mRNA进行转录后调控。但miRNA与靶基因之间并不是完全互补,所以通过序列计算方式预测的靶基因中假阳性也是很高的。单独验证预测的靶基因不能确定是否正确且费时费力,高通量测序与计算预测结合可以很好地验证和发现miRNA的靶基因。介绍了寻找miRNA靶基因的降解组测序方法,包括降解组测序的方法原理、试验流程、miRNA靶基因寻找等主要环节。经研究发现,降解组测序已经成为寻找miRNA靶基因的常用方法。

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