基于网络公开测序数据的K326烟草线粒体基因组RNA编辑位点的鉴定与分析

摘要

为探索RNA编辑位点在烟草线粒体中的分布和功能,通过分析烟草根、花、叶的基因组及转录组测序数据,鉴定了烟草线粒体中从胞嘧啶(C)转换为尿嘧啶(U)的RNA编辑位点.结果显示,在烟草线粒体上共发现了4212个RNA编辑位点,其中30.2％的RNA编辑位点位于蛋白编码基因(rps3、mat-R和ccmFN为RNA编辑位点最多的3个蛋白编码基因),62个RNA编辑位点属于产生的无义突变或使终止密码子丢失的位点.对根、花、叶的RNA编辑位点进行比较,叶的位点最多,为2923个.对这3种器官的特异无义突变RNA编辑位点进行分析,发现其所在的基因参与了氧化呼吸链的电子传递、蛋白合成等过程.同时553个RNA编辑位点位于开放阅读框基因上,说明这些开放阅读框基因可能也参与了线粒体某些功能的完成.