靶基因

摘要： 目的探索miR⁃135b⁃5p在口腔鳞状细胞癌(oral squamouscellcarcinoma,OSCC)及癌旁组织中的表达及其临床意义,预测miR⁃135b⁃5p靶基因并进行相关生物信息学分析。方法通过肿瘤与癌症基因图谱(the CancerGenomeAtlas,TCGA)、基因表达数据库(Gene ExpressionOmnibus,GEO)数据库分析miR⁃135b⁃5p在OSCC组织和癌旁组织中的表达并分析其临床意义;临床收集新鲜组织标本,采用实时荧光定量PCR验证不同组织中miR⁃135b⁃5p的表达情况。采用生物信息学方法预测miR⁃135b⁃5p的靶基因并进行通路富集分析。构建蛋白互作网络筛选关键靶基因。结果OSCC组织中miR⁃135b⁃5p表达量较癌旁组织上调,差异有统计学意义(P<0.001);miR⁃135b⁃5p表达量对OSCC组织具有良好的诊断效能(AUC=0.960,P<0.001);OSCC组织中miR⁃135b⁃5p表达水平与组织病理分级相关(P=0.011);生信分析结果显示,miR⁃135b⁃5p的靶基因富集在与肿瘤相关的钙离子、cGMP⁃PKG、cAMP信号通路中;筛选得到10个关键靶基因:DLG2、ANK3、ERBB4、SCN2B、NBEA、GABRB2、ATP2B2、SNTA1、CACNA1D、SPTBN4。结论miR⁃135b⁃5p可作为一种促癌基因参与OSCC的发生发展,并具有成为OSCC诊断标志物及治疗靶点的潜在应用价值。

摘要： 目的探索miR⁃135b⁃5p在口腔鳞状细胞癌(oral squamouscellcarcinoma,OSCC)及癌旁组织中的表达及其临床意义,预测miR⁃135b⁃5p靶基因并进行相关生物信息学分析。方法通过肿瘤与癌症基因图谱(the CancerGenomeAtlas,TCGA)、基因表达数据库(Gene ExpressionOmnibus,GEO)数据库分析miR⁃135b⁃5p在OSCC组织和癌旁组织中的表达并分析其临床意义;临床收集新鲜组织标本,采用实时荧光定量PCR验证不同组织中miR⁃135b⁃5p的表达情况。采用生物信息学方法预测miR⁃135b⁃5p的靶基因并进行通路富集分析。构建蛋白互作网络筛选关键靶基因。结果OSCC组织中miR⁃135b⁃5p表达量较癌旁组织上调,差异有统计学意义(P<0.001);miR⁃135b⁃5p表达量对OSCC组织具有良好的诊断效能(AUC=0.960,P<0.001);OSCC组织中miR⁃135b⁃5p表达水平与组织病理分级相关(P=0.011);生信分析结果显示,miR⁃135b⁃5p的靶基因富集在与肿瘤相关的钙离子、cGMP⁃PKG、cAMP信号通路中;筛选得到10个关键靶基因:DLG2、ANK3、ERBB4、SCN2B、NBEA、GABRB2、ATP2B2、SNTA1、CACNA1D、SPTBN4。结论miR⁃135b⁃5p可作为一种促癌基因参与OSCC的发生发展,并具有成为OSCC诊断标志物及治疗靶点的潜在应用价值。

摘要： 目的:探讨微小RNA-195(miR-195)对肝癌Hep3B细胞凋亡的影响,并探索其下游靶基因。方法:采用MTT实验、流式细胞仪检测miR-195对肝癌Hep3B细胞增殖及凋亡的影响。构建双荧光素酶报告基因质粒,采用双荧光素酶报告基因实验验证靶标分子。采用RNA干扰技术检测沉默BIRC5对肝癌Hep3B细胞增殖及凋亡的影响。结果:与miR-ctrl组相比,miR-195过表达可抑制肝癌Hep3B细胞增殖,促进其凋亡。双荧光素酶报告基因实验表明,miR-195可靶向作用BIRC5,沉默BIRC5可抑制肝癌Hep3B细胞增殖,促进其凋亡。结论:miR-195可通过靶向调控BIRC5抑制肝癌Hep3B细胞增殖,促进其凋亡。BIRC5可能是肝癌靶向治疗的重要靶标。

摘要： 目的利用生物信息学技术预测人微小RNA-142-5p(hsa-miR-142-5p)的靶基因,并通过分析靶基因涉及的生物学过程和信号通路初步探讨hsa-miR-142-5p在心血管疾病中的作用。方法使用miRGator v3.0数据库检索hsa-miR-142-5p在各个组织器官中的表达情况。使用PubMed数据库检索hsa-miR-142-5p的相关文献,结合miRBase 22.1和UCSC Genome Browser的检索结果,获得hsa-miR-142-5p定位、碱基序列和物种保守性等基本信息。通过数据库TargetScan、DIANA TOOLS、miRDB、miRWalk进行靶基因预测后取交集,再与miRTarBase数据库中被实验验证的靶基因合并作为基因集。取基因集进行基因本体论功能富集分析和京都基因与基因组百科全书信号通路富集分析。结果hsa-miR-142-5p在心脏中存在基础表达量,在包括人类在内的26个不同物种中高度保守。共获得包含51个候选基因的靶基因集,靶基因功能富集于心内膜垫融合、胚胎心管形态发生、心脏心室形态发生和心肌肥厚的调节、心脏上皮向间质转化的正调控等心血管相关的生物学过程(P<0.05),并参与磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路、黏附连接、转化生长因子β(TGF-β)信号通路、甲状腺激素信号通路、Rap1信号通路和叉头框蛋白O(FoxO)信号通路等调控(均P<0.05)。结论hsa-miR-142-5p的靶基因可能与先天性心脏病、心肌肥厚、心肌纤维化及血管平滑肌细胞和血管内皮细胞的调控相关,而PI3K/Akt信号通路、黏附连接、TGF-β信号通路、甲状腺激素信号通路、Rap1信号通路和FoxO信号通路可能参与上述病理生理。

摘要： 目的:探讨miR-29b-3p在脑胶质瘤中的核心靶基因,并分析核心靶基因的临床意义。方法:采用生物信息学分析方法预测、筛选miR-29b-3p的靶基因;使用STRING、Cytoscape软件分析靶基因的蛋白间互相作用(protein-protein interaction,PPI);用GEPIA、CGGA分析其在胶质瘤中的不同状态下的表达差异及生存预后,单因素、多因素Cox比例风险回归模型分析影响预后的独立因素。结果:通过LinkedOmics、miRDB、miRTarBase、TargetScan和starbase数据库预测出22个miR-29b-3p的靶基因,通过构建PPI网络,去除未参与网络关系的基因,综合GEPIA与CGGA数据库分析,剔除COL2A1、DNMT3A和DNMT3B,进一步通过多因素Cox比例风险回归模型分析,最终确定3个核心靶基因:SERPINH1、LOXL2、CDK6。结论:生物信息学分析显示miR-29b-3p在脑胶质瘤中靶向SERPINH1、LOXL2、CDK6基因,各基因的表达量在正常脑组织与肿瘤组织间、肿瘤不同级别间、IDH突变状态和1p/19q共缺失状态下存在差异,其高表达对总生存预后、无复发生存预后存在不良影响,且可作为独立预后因素。

摘要： 【目的】通过对苏禽3号肉鸡的miR-10b-5p进行靶基因预测、生物信息学分析及其在鸡不同生长时期组织表达变化规律研究,探索其在鸡肌肉生长发育中作用。【方法】通过文献和miRBase检索脊椎动物的miR-10b-5p序列,利用Ensembl数据库查询并确定miR-10b-5p在基因组中的位置,根据前体序列构建系统进化树;使用miRDB、microT和TargetScan网站预测miR-10b-5p靶基因,并对靶基因进行GO功能和KEGG通路分析,进而揭示miR-10b-5p的基因功能。采用实时荧光定量PCR技术检测不同生长时期鸡miR-10b-5p组织表达量,探索其在大脑、小脑、垂体、下丘脑、胸肌、腿肌、卵巢、心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中表达变化。【结果】miRBase检索共获得59种动物59条miR-10b-5p序列,即每一种动物都只有一种miR-10b-5p形式。基因定位分析发现,鸡miR-10b-5p位于2号染色体上的HOX基因家族中。常见物种miR-10b-5p成熟序列比对分析结果表明,miR-10b-5p的成熟序列相似性较高,物种间较为保守。系统进化树分析发现,miR-10b在哺乳类中的灵长目、啮齿目、鸟类、鱼类中各自先聚为一支,然后再共同聚为一类,这表明miR-10b在进化过程中是保守的。靶基因预测发现,miR-10b-5p共有300个靶基因。GO功能分析发现,靶基因主要富集到染色质组装和基因表达的转录后调控、组蛋白甲基转移酶复合物、转录因子复合物等功能。KEGG通路分析表明,靶基因主要富集到Wnt和p53信号通路上。组织表达分析显示,miR-10b-5p在检测的各个组织中均有表达;3日龄时大脑、小脑、垂体、胸肌和腿肌中miR-10b-5p表达量显著高于心脏、下丘脑、肾脏和肺脏等组织(P<0.05);90日龄时,垂体、胸肌、腿肌和大脑中miR-10b-5p表达量显著高于其他组织(P<0.05)。与3日龄雏鸡相比,90日龄时垂体、胸肌和腿肌中miR-10b-5p表达量均显著上升(P<0.05)。【结论】鸡miR-10b-5p是组织广泛表达的miRNA,miR-10b在进化过程中是保守的,其可能通过Wnt及p53信号通路调控肌肉细胞增殖分化,进而调控鸡肌肉生长发育。

摘要： 目的 探讨uc.339经miR-95/K-RAS促进肾癌细胞增殖、凋亡和迁移的机制。方法 收集76例肾透明细胞癌组织及癌旁正常组织,应用RNA原位杂交技术检测uc.339表达情况,并分析其与肾透明细胞癌患者病理参数的相关性。CCK-8法检测肾癌细胞增殖活性;Annexin V/PI法检测细胞凋亡;Transwell小室检测肾癌细胞的迁移能力;双荧光素酶报告实验验证miR-95对靶基因K-RAS的调控;Western blot方法分析uc.339下游基因蛋白的表达。结果 uc.339在肾透明细胞癌组织中呈阳性表达,占77.63%(59/76),其阳性表达与肿瘤大小、肿瘤TNM分期均密切相关(P<0.05)。uc.339对肾癌细胞迁移能力无影响。过表达uc.339促进肾癌增殖活性、抑制细胞凋亡,而降低uc.339表达则抑制肾癌增殖活性、促进细胞凋亡(P<0.05)。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证uc.339下游靶基因是微小RNA-95(miR-95);双荧光素酶报告基因实验表明miR-95与K-RAS的结合具有特异性,K-RAS是miR-95的直接靶基因。Western blot和Rescue实验表明无论uc.339和miR-95如何变化,K-RAS都能受到uc.339的调控。结论 在肾癌中,uc.339抑制了miR-95的表达,进而升高K-RAS蛋白水平,促进肾癌生长。本研究为今后诊断和治疗肾癌提供有力的理论依据。

摘要： 本研究旨在探索序列变异对miR-378的结构、表达水平以及靶标关系的影响。利用PCR测序比对不同猪种miR-378的序列突变,预测突变对miR-378二级结构和自由能的改变;构建miR-378表达载体检测突变对其加工过程中各级产物表达水平的作用;运用TargetScan和TargetRank对突变引起的靶标关系变化进行分析;采用microRNA pull-down技术验证突变对靶标关系的影响。结果发现,在荣昌猪和内江猪群体内pre-miR-378的+49和+68位均发生A>G的序列变异,且改变了pre-miR-378的二级结构和自由能;这两个位点突变后影响了pri-miR-378到pre-miR-378的加工过程,提升了pre-miR-378和成熟体miR-378的表达水平;同时+49/A>G的突变改变了miR-378的功能及其靶标关系,其中GDF6和RAB10分别为突变后获得和缺失的靶基因,而Runx1t1、Galnt3为不受突变影响的靶基因。本研究的结果强调了miRNAs序列变异的重要性及其对miRNAs生物发生和功能的显著影响。

摘要： 为探究miRNA-139进化进程及其潜在靶基因功能,以及miR-139在猪睾丸发育过程中的表达差异和变化规律,本研究通过miRbase数据库获取全物种miR-139成熟序列,在Ensembl数据库中定位miR-139在多物种基因组中的位置;通过MEGA X软件选用邻近法构建关于miR-139的系统进化树;利用RT-qPCR实验技术分析miR-139在沙子岭猪7个时期(D1、D30、D60、D90、D120、D150和D180)的睾丸组织细胞中的差异表达及变化,并使用Targetscan等多个在线软件预测可能与猪miR-139结合的靶基因,对靶基因进行GO和KEGG分析。结果显示:miR-139基因在进化过程中具有较高的保守性;定量结果显示,miR-139在猪睾丸组织7个时期有差异表达,1~90 d的表达水平逐渐降低,在性发育期120 d上升又在150 d有所下降,性成熟期表达水平又显著升高;miR-139靶基因GO和KEGG分析结果显示,miR-139的靶基因主要起结合、转录前调节的作用,多个基因富集在对畜禽繁殖和生长发育有重要调控作用的信号通路;4种在线软件取交集预测保守猪源候选靶基因有25个,为SCHIP1、WDR26、DMD、MIER3、DPYSL5、CANX、ASH1L、AJAP1等。本研究发现,miR-139在物种进化过程中高度保守,并对猪睾丸的生长发育有重要影响作用,这一结果为后续进一步探讨miR-139调控猪精子发生的过程提供了理论基础。

摘要： 目的发生在microRNA基因前体或成熟序列或靶基因3′非翻译区结合位点的单核苷酸多态性(SNP)可能通过影响microRNA对靶基因的识别调控过程,参与许多疾病如肿瘤、神经系统疾病、肌肥大、心血管疾病等的发生发展过程。本研究采用生物信息学技术分析位于miR-499a-3p种子序列第4位的SNP rs386585341 A>G可能影响生物学过程及信号通路。方法应用RNAfold数据库预测rs386585341 A>G是否影响pre-miR-499a的二级结构,分别构建pre-miR-499a-A和pre-miR-499a-G过表达质粒检测rs386585341 A>G是否影响成熟miR-499a的表达,利用基因表达谱芯片和生物信息学分析rs386585341 A>G对miR-499a-3p功能的影响,取差异基因表达谱和TargetScan靶基因交集,分析rs386585341不同等位点miR-499a-3p-A和miR-499a-3p-G靶基因差异。结果rs386585341 A>G不影响pre-miR-499a的二级结构,也不影响成熟miR-499a-5p和miR-499a-3p的表达水平,但影响成熟miR-499a-3p调控的靶基因网络。取差异表达基因(DEG)谱行GO和pathway分析,发现miR-499a-3p-A和miR-499a-3p-G展示不同的生物学功能,miR-499a-3p-A的下游基因网络主要富集在免疫调控方面,而miR-499a-3p-G的下游基因网络主要富集在血管新生方面;下调表达基因和TargetScan靶基因交集分析得到4个miR-499a-3p-A直接靶基因(Spry2、Pcnx、Ndufa5及Tcf7l2),而未能得到miR-499a-3p-G直接靶基因,提示miR-499a-3p种子区域第4号位由A转换成G后,调控靶基因方式可能由促进靶基因mRNA的降解转换为仅抑制靶基因的蛋白翻译。结论rs386585341 A>G可能通过影响miR-499a-3p下游调控网络在免疫和血管新生方面发挥功能。

摘要： 目的：对外周血中食管鳞癌相关的7种miRNAs进行circRNAs及其靶基因的预测,分析其与circRNAs及靶基因间的相互作用. 方法：根据前期进行系统综述和meta分析所获得的miRNAs,分别采用starBase及miRWALK对miR-18a、miR-21、mi-25、miR-31、miR-185、miR-223、miR-373的circRNAs和靶基因进行生物信息学预测,利用Cytoscape软件对这7种miRNAs和预测所得到的circRNAs及相应的靶基因进行网络分析,并进一步通过DAVID软件对预测的靶基因进行通路分析. 结果：由starBase对这7种miRNAs预测的circRNAs数量分别为33、15、34、23、24、19和43个.其中SP140_hsa_circ_001735和SP140_hsa_circ_001283与miR-21、miR-25和miR-373等3种miRNAs相互作用,ISY1_hsa-circ_001859与miR-18a、miR-21和miR-31等3种miRNAs相互作用,ZNF264_hsa_circ_001634与miR-25、miR-31和miR-373等3种miRNAs相互作用.在miRWALK中7-8个以上数据库预测到的靶基因中,RSBN1基因是miR-25、miR-31、miR-185和miR-373等4种miRNAs相对应的靶基因,PDZD2基因是miR-18a、miR-21、miR-25和miR-31等4种miRNAs相对应的靶基因.RASA1基因是在2种预测范围内与miR-21、miR-31和miR-223等3种miRNAs相对应的靶基因.在7种miRNAs所预测的靶基因相关KEGG信号通路中,7-8个数据库以上共有的信号通路为TGF-beta信号通路、Cell cycle信号通路、ErbB信号通路、PI3K-Akt信号通路、Pathways in cancer和Signaling pathways regulating pluripotency of stemcells. 结论：本研究对外周血中食管鳞癌相关的miRNAs及其相互作用的circRNAs、靶基因和信号通路进行了生物信息学预测和网络分析,有助于进一步研究miRNAs在食管鳞癌发生、发展过程中的调控作用和方式.

摘要： miRNA在卵巢的功能已经被揭示,影响性腺发育,排卵,细胞凋亡,激素合成和黄体(CL)发育等过程.在本研究中,分析了miR-29b在牛CL发育不同阶段的表达,并预测了miR-29b的靶基因.证实了miR-29b能够降低OXTR(催产素受体)的表达,影响PROG分泌并调节CL的功能.实时定量RT-PCR结果显示,功能性CL中miR-29b的表达明显高于退化期CL.免疫组化实验显示OXTR在大,小CL细胞中都有表达,主要分布在细胞膜和细胞质中.发现哦过表达miR-29b能够下调OXTR的表达,而抑制miR-29b,不会显著影响OXTR的表达.同时,过表达miR-29b也能增加PROG的分泌.总之,发现miR-29b降低了OXTR的表达,促进了PROG分泌和CL细胞的增殖.

摘要： 利用高通量测序的方法筛选出在高脂奶牛和低脂奶牛中差异表达的miR-877和其预测的靶基因.通过生物信息学方法预测出EDN1,PTGIS可能是miR-877的靶基因,之后通过荧光定量检测miR-877以及其靶基因的表达量.结果显示:转染miR-877的相对表达量.转染miR-877mimics组表达量显著高于转染miR-877inhibitor组.靶基因的相对表达量.转染miR-877mimics组的EDN1,PTGIS基因表达水平均显著低于转染miR-877inhibitor组(P＜0.01).经GraphPadPrism6分析显示EDN1,PTGIS基因的相对表达量与miR-877的表达量呈负相关,初步验证EDN,PTGIS是miR-877的靶基因.为深入了解miR-877在乳脂质代谢调节中的作用提供依据,从而为生产实践提供一定的理论基础和指导.

摘要： 目的：为初步探究miR-15b的生物学功能. 方法：利用TargetScan Release7.0,PicTar和PITA数据库对miR-15b靶基因进行预测,随后用DAVID数据库对预测出的靶基因集进行功能富集分析(Gene Ontology-analysis)及信号转导通路富集分析(KEGG Pathwayanalysis),并对其中的两个靶基因通过双萤光素酶报告系统进行了验证. 结果：三个软件共同预测出miR-15b的靶基因有305个,靶基因集合功能富集于蛋白激酶活性、GTP结合蛋白调控等分子功能,蛋白氨基酸磷酸化、细胞周期调控等生物学过程及微管相关复合体、转录因子复合体等细胞组分上.信号转导通路则显著富集于癌症相关信号通路.随后对预测出的能量代谢通路相关miR-15b靶基因丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)和免疫相关功能靶基因CD28基因进行验证,实验结果显示CD28为miR-15b的靶基因,而PDK4不是miR-15b的靶基因. 结论：miR-15b可能会通过靶向CD28参与T细胞的免疫应答过程.

摘要： MiRNA是小的RNA调节分子,长度一般在20个碱基左右,通过与目标mRNA结合而导致mR-NA的解链或者是抑制其翻译.研究表明,拟南芥miRNA167参与调节花器官的发育,然而miRNA167在姜科植物中功能还未见报道.白姜花作为一种芳香植物,具有浓郁的花香,且花香物质释放与花的发育进程密切相关.本研究克隆了白姜花中miRNA167家族的miRNA167a和miRNA167k并对其进行了靶基因的预测及靶基因功能域的分析,为研究姜花miRNA167调控花香物质合成的分子机制奠定基础.

摘要： 目的：探讨miR-31在宫颈癌组织中的表达,并对其进行靶基因功能预测等生物信息学分析,以期为miR-31在宫颈癌发生中的作用机制研究提供理论和实验基础. 方法：应用实时荧光定量PCR技术检测宫颈癌组织及阴性对照组中miR-31相对表达量;通过mirecord网站对miR-31进行靶基因预测,并利用DAVID对靶基因进行GO(gene ontology)功能富集分析及KEGG信号转导通路富集分析. 结果：宫颈癌患者组织中miR-31表达(4.53±1.64)水平高于阴性对照组(7.46±1.38);miR-31预测靶基因集合功能富集于生物学调控、蛋白代谢、细胞过程,有机体的发育等生物学过程,以及蛋白结合、底物特异性的跨膜转运活动等分子功能上;KEGG通路分析涉及癌症通路、粘着连接、内吞作用、黑色素瘤、长时程增强、轴突导向等. 结论：miR-31在宫颈癌组织中呈现高表达,miR-31预测靶基因集合显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中.

摘要： 目的：探讨miR-497-195基因簇在宫颈癌组织中的表达,并对其预测的靶基因进行生物信息学分析,为miRNA-497-195基因簇在宫颈癌发生中的作用机制研究提供理论基础. 方法：用real-time RT-PCR对miR-497和miR-195在宫颈癌组织中的表达进行相关性分析.利用miRNA芯片技术检测宫颈癌组织中miRNA表达谱,用real-time RT-PCR进行验证;通过生物信息学预测miR-497和miR-195的靶基因,并对其靶基因进行GO(gene ontology)功能富集分析及信号转导通路富集分析. 结果：miR-497和miR-195在宫颈癌组织中的表达呈明显的相关性.芯片结果显示宫颈癌组织中有15个miRNAs表达为上调(＞2倍),10个miRNAs表达为下调(＜0.5倍),其中miR-195和miR-497显示为下调.miR-497和miR-195预测靶基因大量重合,且集合功能也大量重合,并富集于细胞周期调控、生物学过程调控、转录调控、基因表达、及核苷酸代谢过程等生物学过程,以及蛋白结合、核酸结合、蛋白激酶活性、连接酶活性等分子功能(p＜0.01);KEGG通路分析涉及癌症通路、p53信号通路、GnRll信号通路、细胞外因子信号通路等信号传导通路及直肠癌、前列腺癌、甲状腺癌、黑色素瘤、慢性粒细胞性白血病、非小细胞肺癌等疾病通路(p＜0.05). 结论：miR-195和miR-497在宫颈癌组织中呈现低表达,二者表达呈相关性,可以作为miR-497-195基因簇来研究其对宫颈癌的影响.miR-497和miR-195预测靶基因功能大量重合,并显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中.

摘要： 目的：本研究利用small RNA-seq技术对球囊菌的纯培养进行测序,对球囊菌的microRNAsmiRNAs)进行预测、鉴定和分析,进而构建miRNAs-mRNAs的调控网络. 方法：利用Illumina Hiseq Xten平台对球囊菌菌丝与孢子进行测序,通过相关生物信息学软件对球囊菌的miRNAs进行预测和分析,通过茎环(Stem-loop)PCR对部分miRNAs进行鉴定,利用Cytoskype软件构建miRNAs-mRNAs的调控网络. 结果：本研究共获得48268696条clean reads,预测出118个球囊菌的miRNAs,它们的长度分布介于18-25nt之间,不同长度的miRNA的首位碱基偏好性差异明显.Stem-loop PCR验证结果显示共有10个miRNAs能够扩增出符合预期的目的片段,说明多数miRNAs可能真实存在.共预测出6529个球囊菌miRNAs的靶基因,其中5725个能够注释到Nr、Swissprot、KOG、GO和KEGG数据库.进一步分析结果显示有24个靶基因注释在MAPK信号通路.Cytoskype软件分析结果显示球囊菌的miRNAs与mRNAs之间存在复杂的调控网络,绝大多数的miRNAs处于调控网络的内部且同时结合多个mRNAs. 结论：本研究率先对球囊菌的miRNAs及miRNAs-mRNAs调控网络进行全面分析,研究结果丰富了对球囊菌miRNAs的认识,为其基础生物学信息提供了有益补充,也为阐明球囊菌致病的分子机理打下了一定基础.

摘要： 以耐盐种质小偃60和感盐种质鲁麦21为材料,利用高通量测序(Hiseq)和生物信息技术分析2种质在200mmol/L NaC1胁迫3h、12h和24h后相关LncRNA及其靶标的表达情况.结果表明,分别鉴定出519个上调和544个下调LncRNA.随盐胁迫时间增加,小偃60差异表达LncRNA数量逐渐增加,鲁麦21先增加后减少,3个时间段耐盐种质的差异表达LncRNA均大于敏感种质.结合耐盐路径,鉴定出小偃60和鲁麦21盐胁迫相关上调LncRNA.这些LncRNA与盐胁迫相关蛋白、酶类等的合成相关,在路径中表现为相对特异性,可通过多种LncRNA共同作用于路径中的靶基因.这些LncRNA可能与冬小麦耐盐性相关,可为冬小麦耐盐性鉴定提供参考.

摘要： 为进一步确定MALAT1基因与子宫颈癌发生、发展及转移的关系,确定MALAT1的调控靶标及其功能,为进一步探索MALAT1的功能和深入研究并揭示子宫颈癌的发展和转移机制提供新的视角和理论基础,并在此基础上寻找治疗子宫颈癌的药物靶点和筛选预测子宫颈癌转移及预后的分子标志物.

摘要： 本发明提供制备和纯化生物系统中存在的靶分子的系统和方法。根据本发明的系统和方法利用转基因表达的多价结合多肽作为纯化该靶分子的亲和介质，以纯化该靶分子。该转基因多价结合多肽既与靶分子(例如靶分子的可结合表位)结合，又与基质结合。

摘要： 本申请涉及描绘肿瘤类型生物标志模式和特征集的基因靶和基因表达的蛋白靶。本文提供了用于鉴定个体用的治疗剂的方法和系统，诸如之前未鉴定用于治疗个体的治疗剂。所述治疗剂可通过分子概况分析来鉴定，诸如确定个体生物样品的生物标志模式或特征集。

摘要： 本文提供了用于鉴定个体用的治疗剂的方法和系统，诸如之前未鉴定用于治疗个体的治疗剂。所述治疗剂可通过分子概况分析来鉴定，诸如确定个体生物样品的生物标志模式或特征集。

摘要： 本发明提供制备和纯化生物系统中存在的靶分子的系统和方法。根据本发明的系统和方法利用转基因表达的多价结合多肽作为纯化该靶分子的亲和介质,以纯化该靶分子。该转基因多价结合多肽既与靶分子(例如靶分子的可结合表位)结合,又与基质结合。

摘要： 本发明公开了一种新颖的大规模锚定并行测序技术，其可用于分离和测序整合序列、从而鉴定宿主基因组中HBV基因整合的重复靶基因；本发明还公开了用于实施该技术的试剂盒；本发明还公开了6个新的被HBV重复整合的基因、以及相关的试剂盒。

摘要： 本发明提供了以杨树纤维素合酶基因为靶基因的五个microRNA基因及应用。本发明的miRNA为具有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4或者SEQ ID NO:5所示序列的miRNA；miRNA在植物中具有特定的表达部位，影响植物特定部位的纤维素合成；将miRNA的前体基因或者成熟miRNA直接放入表达载体中，转化至植物后可在植物体内形成有颈环结构的前体，然后被加工修饰形成成熟miRNAs，进而抑制或影响基因的表达，达到对基因进行修饰的目标。

摘要： 本发明公开了一种新颖的大规模锚定并行测序技术，其可用于分离和测序整合序列、从而鉴定宿主基因组中HBV基因整合的重复靶基因；本发明还公开了用于实施该技术的试剂盒；本发明还公开了6个新的被HBV重复整合的基因、以及相关的试剂盒。

摘要： 本发明提供了一种在全基因组水平上预测植物生长发育转录因子调控的下游靶基因的方法，属于生物信息技术领域。本发明的方法基于植物转录因子的DAP‑seq测序数据，在全基因组中检测调控的启动子的Motif元件和位置，并以此为基础，预测转录因子下游调控的靶基因。本发明联合测序数据和生物信息学工具，大大增加了预测的精确度和通量，进而可在大数据量的基础上快速预测出靶基因，提高预测效率。并且本发明的方法普遍适用于植物学领域。

摘要： 本发明公开了大丽轮枝菌VdNRPS3基因抗病原菌靶基因片段及其干扰载体和应用。本发明以大丽轮枝菌的VdNRPS3作为靶标基因，通过VIGS技术研究其与病原菌致病力之间的关系并利用转基因和RNAi技术相结合获得能够显著提高植物抗性的靶基因片段，其核苷酸序列分别为SEQ ID No.2、SEQ ID No.3或SEQ ID No.5所示。本发明进一步提供了采用所述靶基因片段构建的Gateway干扰载体。本发明的大丽轮枝菌VdNRPS3基因抗病原菌靶基因片段以及采用该靶基因片段构建的Gateway干扰载体能应用于提高作物对大丽轮枝菌所导致病害的抗性以及培育抗大丽轮枝菌的转基因植物新品种等方面。

摘要： 本发明公开了大丽轮枝菌VdNRPS2基因抗病原菌靶基因片段及其干扰载体和应用。本发明提供了大丽轮枝菌VdNRPS2基因抗病原菌靶基因片段，其核苷酸序列分别为SEQ ID No.1、SEQ ID No.3或SEQ ID No.5所示。本发明进一步提供了采用所述靶基因片段构建的Gateway干扰载体。本发明提供的大丽轮枝菌VdNRPS2基因抗病原菌靶基因片段以及采用该靶基因片段所构建的Gateway干扰载体能应用于提高作物对大丽轮枝菌所导致病害的抗性以及培育抗大丽轮枝菌的转基因植物新品种等方面。