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病毒整合位点捕获测序分析方法

摘要

一种病毒整合位点捕获测序分析方法,该方法包括:将人的参考序列和病毒的参考序列合并在一起,构建一个混合参考序列;读取测序数据,过滤其中不合格的部分,得到过滤后的测序数据;利用比对软件将处理后的测序数据比对到混合参考序列上,获取一个比对结果,然后对该比对结果进行处理,得到一个用于检测病毒整合的比对结果;根据该用于检测病毒整合的比对结果,执行相应的操作,获取病毒整合的相关序列;综合上述相关序列的比对信息,获取病毒整合位点在参考序列上的坐标;综合整合位点的坐标信息,得到并输出病毒整合结果。利用本发明可以获得具有高精确度的病毒整合位点信息。

著录项

  • 公开/公告号CN103993069B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-04-28

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 深圳华大基因科技服务有限公司;

    申请/专利号CN201410109470.1

  • 发明设计人 丘坤龙;何铭辉;

    申请日2014-03-21

  • 分类号C12Q1/70(20060101);C12Q1/6869(20180101);G16B30/10(20190101);

  • 代理机构44260 深圳市兴科达知识产权代理有限公司;

  • 代理人王翀

  • 地址 518083 广东省深圳市盐田区北山工业区11栋

  • 入库时间 2022-08-23 10:56:39

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-04-28

    授权

    授权

  • 2017-03-29

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/68 申请日:20140321

    实质审查的生效

  • 2017-03-29

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q 1/68 申请日:20140321

    实质审查的生效

  • 2014-08-20

    公开

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  • 2014-08-20

    公开

    公开

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